Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCDHB2Q9Y5E7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCDHB2Q9Y5E7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCDHB2Q9Y5E7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCDHB2Q9Y5E7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCDHB2Q9Y5E7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PCDHB2Q9Y5E7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCDHB2Q9Y5E7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PCDHB2Q9Y5E7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCDHB2Q9Y5E7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCDHB2Q9Y5E7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PCDHB2Q9Y5E7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCDHB2Q9Y5E7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCDHB2Q9Y5E7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCDHB2Q9Y5E7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCDHB2Q9Y5E7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCDHB2Q9Y5E7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCDHB2Q9Y5E7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCDHB2Q9Y5E7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCDHB2Q9Y5E7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PCDHB2Q9Y5E7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCDHB2Q9Y5E7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCDHB2Q9Y5E7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCDHB2Q9Y5E7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PCDHB2Q9Y5E7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDHB2Q9Y5E7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDHB2Q9Y5E7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDHB2Q9Y5E7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDHB2Q9Y5E7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDHB2Q9Y5E7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDHB2Q9Y5E7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDHB2Q9Y5E7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDHB2Q9Y5E7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDHB2Q9Y5E7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDHB2Q9Y5E7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDHB2Q9Y5E7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDHB2Q9Y5E7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDHB2Q9Y5E7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDHB2Q9Y5E7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDHB2Q9Y5E7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PCDHB2Q9Y5E7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDHB2Q9Y5E7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDHB2Q9Y5E7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDHB2Q9Y5E7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDHB2Q9Y5E7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDHB2Q9Y5E7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDHB2Q9Y5E7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDHB2Q9Y5E7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDHB2Q9Y5E7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHB2Q9Y5E7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHB2Q9Y5E7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHB2Q9Y5E7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHB2Q9Y5E7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHB2Q9Y5E7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDHB2Q9Y5E7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDHB2Q9Y5E7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHB2Q9Y5E7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHB2Q9Y5E7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHB2Q9Y5E7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHB2Q9Y5E7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHB2Q9Y5E7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHB2Q9Y5E7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHB2Q9Y5E7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHB2Q9Y5E7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHB2Q9Y5E7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHB2Q9Y5E7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDHB2Q9Y5E7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDHB2Q9Y5E7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDHB2Q9Y5E7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDHB2Q9Y5E7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCDHB2Q9Y5E7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCDHB2Q9Y5E7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCDHB2Q9Y5E7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PCDHB2Q9Y5E7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCDHB2Q9Y5E7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCDHB2Q9Y5E7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCDHB2Q9Y5E7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDHB2Q9Y5E7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDHB2Q9Y5E7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDHB2Q9Y5E7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDHB2Q9Y5E7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDHB2Q9Y5E7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDHB2Q9Y5E7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDHB2Q9Y5E7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDHB2Q9Y5E7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDHB2Q9Y5E7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDHB2Q9Y5E7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDHB2Q9Y5E7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDHB2Q9Y5E7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDHB2Q9Y5E7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDHB2Q9Y5E7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDHB2Q9Y5E7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDHB2Q9Y5E7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDHB2Q9Y5E7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDHB2Q9Y5E7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDHB2Q9Y5E7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms