Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
DCAF1Q9Y4B6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC47.44■■■■■ 5.19
DCAF1Q9Y4B6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.44■■■■■ 5.18
DCAF1Q9Y4B6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC47.44■■■■■ 5.18
DCAF1Q9Y4B6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.42■■■■■ 5.18
DCAF1Q9Y4B6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.42■■■■■ 5.18
DCAF1Q9Y4B6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.41■■■■■ 5.18
DCAF1Q9Y4B6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.41■■■■■ 5.18
DCAF1Q9Y4B6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.41■■■■■ 5.18
DCAF1Q9Y4B6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC47.4■■■■■ 5.18
DCAF1Q9Y4B6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.39■■■■■ 5.18
DCAF1Q9Y4B6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC47.39■■■■■ 5.18
DCAF1Q9Y4B6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC47.38■■■■■ 5.18
DCAF1Q9Y4B6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.38■■■■■ 5.18
DCAF1Q9Y4B6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC47.38■■■■■ 5.18
DCAF1Q9Y4B6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC47.38■■■■■ 5.18
DCAF1Q9Y4B6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC47.37■■■■■ 5.17
DCAF1Q9Y4B6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC47.37■■■■■ 5.17
DCAF1Q9Y4B6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC47.36■■■■■ 5.17
DCAF1Q9Y4B6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC47.36■■■■■ 5.17
DCAF1Q9Y4B6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.35■■■■■ 5.17
DCAF1Q9Y4B6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC47.35■■■■■ 5.17
DCAF1Q9Y4B6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC47.35■■■■■ 5.17
DCAF1Q9Y4B6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC47.35■■■■■ 5.17
DCAF1Q9Y4B6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.34■■■■■ 5.17
DCAF1Q9Y4B6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC47.33■■■■■ 5.17
DCAF1Q9Y4B6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.33■■■■■ 5.17
DCAF1Q9Y4B6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC47.32■■■■■ 5.17
DCAF1Q9Y4B6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC47.32■■■■■ 5.17
DCAF1Q9Y4B6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
DCAF1Q9Y4B6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC47.31■■■■■ 5.16
DCAF1Q9Y4B6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.3■■■■■ 5.16
DCAF1Q9Y4B6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.3■■■■■ 5.16
DCAF1Q9Y4B6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC47.3■■■■■ 5.16
DCAF1Q9Y4B6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC47.29■■■■■ 5.16
DCAF1Q9Y4B6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.29■■■■■ 5.16
DCAF1Q9Y4B6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.29■■■■■ 5.16
DCAF1Q9Y4B6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC47.29■■■■■ 5.16
DCAF1Q9Y4B6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC47.28■■■■■ 5.16
DCAF1Q9Y4B6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
DCAF1Q9Y4B6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC47.27■■■■■ 5.16
DCAF1Q9Y4B6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC47.26■■■■■ 5.16
DCAF1Q9Y4B6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.26■■■■■ 5.16
DCAF1Q9Y4B6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC47.26■■■■■ 5.16
DCAF1Q9Y4B6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC47.25■■■■■ 5.16
DCAF1Q9Y4B6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC47.25■■■■■ 5.15
DCAF1Q9Y4B6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC47.25■■■■■ 5.15
DCAF1Q9Y4B6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC47.25■■■■■ 5.15
DCAF1Q9Y4B6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.24■■■■■ 5.15
DCAF1Q9Y4B6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.23■■■■■ 5.15
DCAF1Q9Y4B6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC47.22■■■■■ 5.15
DCAF1Q9Y4B6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.22■■■■■ 5.15
DCAF1Q9Y4B6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC47.22■■■■■ 5.15
DCAF1Q9Y4B6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
DCAF1Q9Y4B6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.21■■■■■ 5.15
DCAF1Q9Y4B6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC47.2■■■■■ 5.15
DCAF1Q9Y4B6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC47.2■■■■■ 5.15
DCAF1Q9Y4B6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.2■■■■■ 5.15
DCAF1Q9Y4B6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC47.2■■■■■ 5.15
DCAF1Q9Y4B6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC47.2■■■■■ 5.15
DCAF1Q9Y4B6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.2■■■■■ 5.15
DCAF1Q9Y4B6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.2■■■■■ 5.15
DCAF1Q9Y4B6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC47.2■■■■■ 5.15
DCAF1Q9Y4B6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC47.2■■■■■ 5.15
DCAF1Q9Y4B6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC47.19■■■■■ 5.14
DCAF1Q9Y4B6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC47.19■■■■■ 5.14
DCAF1Q9Y4B6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
DCAF1Q9Y4B6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC47.17■■■■■ 5.14
DCAF1Q9Y4B6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC47.17■■■■■ 5.14
DCAF1Q9Y4B6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
DCAF1Q9Y4B6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.16■■■■■ 5.14
DCAF1Q9Y4B6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
DCAF1Q9Y4B6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.16■■■■■ 5.14
DCAF1Q9Y4B6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC47.15■■■■■ 5.14
DCAF1Q9Y4B6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.15■■■■■ 5.14
DCAF1Q9Y4B6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC47.14■■■■■ 5.14
DCAF1Q9Y4B6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC47.14■■■■■ 5.14
DCAF1Q9Y4B6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.13■■■■■ 5.14
DCAF1Q9Y4B6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.13■■■■■ 5.14
DCAF1Q9Y4B6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC47.13■■■■■ 5.14
DCAF1Q9Y4B6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC47.13■■■■■ 5.14
DCAF1Q9Y4B6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.12■■■■■ 5.13
DCAF1Q9Y4B6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC47.11■■■■■ 5.13
DCAF1Q9Y4B6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.11■■■■■ 5.13
DCAF1Q9Y4B6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC47.1■■■■■ 5.13
DCAF1Q9Y4B6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
DCAF1Q9Y4B6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC47.09■■■■■ 5.13
DCAF1Q9Y4B6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.09■■■■■ 5.13
DCAF1Q9Y4B6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC47.09■■■■■ 5.13
DCAF1Q9Y4B6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.09■■■■■ 5.13
DCAF1Q9Y4B6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC47.09■■■■■ 5.13
DCAF1Q9Y4B6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
DCAF1Q9Y4B6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC47.08■■■■■ 5.13
DCAF1Q9Y4B6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
DCAF1Q9Y4B6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.07■■■■■ 5.13
DCAF1Q9Y4B6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC47.07■■■■■ 5.13
DCAF1Q9Y4B6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.07■■■■■ 5.13
DCAF1Q9Y4B6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC47.06■■■■■ 5.12
DCAF1Q9Y4B6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC47.06■■■■■ 5.12
DCAF1Q9Y4B6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC47.06■■■■■ 5.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms