Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KIF3AQ9Y496 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
KIF3AQ9Y496 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KIF3AQ9Y496 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KIF3AQ9Y496 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KIF3AQ9Y496 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIF3AQ9Y496 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIF3AQ9Y496 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIF3AQ9Y496 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KIF3AQ9Y496 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KIF3AQ9Y496 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KIF3AQ9Y496 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KIF3AQ9Y496 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KIF3AQ9Y496 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KIF3AQ9Y496 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KIF3AQ9Y496 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIF3AQ9Y496 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIF3AQ9Y496 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIF3AQ9Y496 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIF3AQ9Y496 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KIF3AQ9Y496 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
KIF3AQ9Y496 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KIF3AQ9Y496 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIF3AQ9Y496 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIF3AQ9Y496 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIF3AQ9Y496 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIF3AQ9Y496 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIF3AQ9Y496 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIF3AQ9Y496 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIF3AQ9Y496 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIF3AQ9Y496 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIF3AQ9Y496 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIF3AQ9Y496 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KIF3AQ9Y496 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIF3AQ9Y496 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIF3AQ9Y496 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
KIF3AQ9Y496 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIF3AQ9Y496 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIF3AQ9Y496 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIF3AQ9Y496 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIF3AQ9Y496 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIF3AQ9Y496 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIF3AQ9Y496 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIF3AQ9Y496 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIF3AQ9Y496 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIF3AQ9Y496 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIF3AQ9Y496 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIF3AQ9Y496 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIF3AQ9Y496 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIF3AQ9Y496 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIF3AQ9Y496 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF3AQ9Y496 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF3AQ9Y496 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF3AQ9Y496 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF3AQ9Y496 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF3AQ9Y496 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF3AQ9Y496 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF3AQ9Y496 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF3AQ9Y496 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF3AQ9Y496 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF3AQ9Y496 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF3AQ9Y496 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF3AQ9Y496 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIF3AQ9Y496 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF3AQ9Y496 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF3AQ9Y496 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF3AQ9Y496 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF3AQ9Y496 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF3AQ9Y496 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF3AQ9Y496 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF3AQ9Y496 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF3AQ9Y496 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIF3AQ9Y496 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIF3AQ9Y496 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIF3AQ9Y496 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIF3AQ9Y496 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIF3AQ9Y496 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIF3AQ9Y496 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIF3AQ9Y496 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIF3AQ9Y496 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIF3AQ9Y496 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIF3AQ9Y496 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIF3AQ9Y496 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIF3AQ9Y496 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KIF3AQ9Y496 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KIF3AQ9Y496 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KIF3AQ9Y496 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KIF3AQ9Y496 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KIF3AQ9Y496 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KIF3AQ9Y496 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KIF3AQ9Y496 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIF3AQ9Y496 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
KIF3AQ9Y496 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIF3AQ9Y496 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIF3AQ9Y496 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIF3AQ9Y496 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF3AQ9Y496 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF3AQ9Y496 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF3AQ9Y496 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIF3AQ9Y496 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms