Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBE2J1Q9Y385 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBE2J1Q9Y385 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE2J1Q9Y385 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE2J1Q9Y385 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE2J1Q9Y385 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE2J1Q9Y385 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE2J1Q9Y385 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE2J1Q9Y385 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE2J1Q9Y385 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE2J1Q9Y385 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE2J1Q9Y385 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE2J1Q9Y385 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE2J1Q9Y385 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE2J1Q9Y385 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE2J1Q9Y385 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE2J1Q9Y385 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBE2J1Q9Y385 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE2J1Q9Y385 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE2J1Q9Y385 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE2J1Q9Y385 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE2J1Q9Y385 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE2J1Q9Y385 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE2J1Q9Y385 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE2J1Q9Y385 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE2J1Q9Y385 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE2J1Q9Y385 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE2J1Q9Y385 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE2J1Q9Y385 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE2J1Q9Y385 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE2J1Q9Y385 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UBE2J1Q9Y385 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE2J1Q9Y385 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE2J1Q9Y385 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE2J1Q9Y385 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBE2J1Q9Y385 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBE2J1Q9Y385 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBE2J1Q9Y385 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE2J1Q9Y385 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE2J1Q9Y385 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE2J1Q9Y385 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE2J1Q9Y385 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE2J1Q9Y385 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE2J1Q9Y385 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE2J1Q9Y385 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE2J1Q9Y385 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE2J1Q9Y385 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE2J1Q9Y385 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE2J1Q9Y385 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE2J1Q9Y385 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE2J1Q9Y385 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE2J1Q9Y385 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE2J1Q9Y385 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2J1Q9Y385 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2J1Q9Y385 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2J1Q9Y385 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2J1Q9Y385 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2J1Q9Y385 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE2J1Q9Y385 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE2J1Q9Y385 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE2J1Q9Y385 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE2J1Q9Y385 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE2J1Q9Y385 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE2J1Q9Y385 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE2J1Q9Y385 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE2J1Q9Y385 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE2J1Q9Y385 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE2J1Q9Y385 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UBE2J1Q9Y385 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE2J1Q9Y385 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE2J1Q9Y385 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE2J1Q9Y385 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE2J1Q9Y385 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE2J1Q9Y385 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE2J1Q9Y385 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE2J1Q9Y385 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE2J1Q9Y385 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE2J1Q9Y385 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE2J1Q9Y385 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms