Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y333

LSM2, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM2Q9Y333 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LSM2Q9Y333 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LSM2Q9Y333 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LSM2Q9Y333 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LSM2Q9Y333 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LSM2Q9Y333 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LSM2Q9Y333 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LSM2Q9Y333 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LSM2Q9Y333 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LSM2Q9Y333 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LSM2Q9Y333 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LSM2Q9Y333 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LSM2Q9Y333 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LSM2Q9Y333 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LSM2Q9Y333 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LSM2Q9Y333 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LSM2Q9Y333 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LSM2Q9Y333 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LSM2Q9Y333 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LSM2Q9Y333 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LSM2Q9Y333 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LSM2Q9Y333 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LSM2Q9Y333 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LSM2Q9Y333 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LSM2Q9Y333 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LSM2Q9Y333 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LSM2Q9Y333 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LSM2Q9Y333 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LSM2Q9Y333 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM2Q9Y333 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM2Q9Y333 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM2Q9Y333 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM2Q9Y333 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM2Q9Y333 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM2Q9Y333 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM2Q9Y333 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LSM2Q9Y333 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSM2Q9Y333 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSM2Q9Y333 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSM2Q9Y333 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LSM2Q9Y333 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSM2Q9Y333 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSM2Q9Y333 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LSM2Q9Y333 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSM2Q9Y333 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSM2Q9Y333 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSM2Q9Y333 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSM2Q9Y333 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSM2Q9Y333 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSM2Q9Y333 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSM2Q9Y333 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSM2Q9Y333 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSM2Q9Y333 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LSM2Q9Y333 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM2Q9Y333 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM2Q9Y333 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM2Q9Y333 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM2Q9Y333 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LSM2Q9Y333 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM2Q9Y333 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM2Q9Y333 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM2Q9Y333 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM2Q9Y333 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM2Q9Y333 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM2Q9Y333 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LSM2Q9Y333 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSM2Q9Y333 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LSM2Q9Y333 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LSM2Q9Y333 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LSM2Q9Y333 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LSM2Q9Y333 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LSM2Q9Y333 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LSM2Q9Y333 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LSM2Q9Y333 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LSM2Q9Y333 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LSM2Q9Y333 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LSM2Q9Y333 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LSM2Q9Y333 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSM2Q9Y333 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSM2Q9Y333 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LSM2Q9Y333 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSM2Q9Y333 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSM2Q9Y333 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSM2Q9Y333 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LSM2Q9Y333 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSM2Q9Y333 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSM2Q9Y333 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSM2Q9Y333 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSM2Q9Y333 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSM2Q9Y333 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSM2Q9Y333 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSM2Q9Y333 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSM2Q9Y333 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSM2Q9Y333 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LSM2Q9Y333 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LSM2Q9Y333 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LSM2Q9Y333 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LSM2Q9Y333 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LSM2Q9Y333 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LSM2Q9Y333 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms