Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y297

BTRC, F-box/WD repeat-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BTRCQ9Y297 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
BTRCQ9Y297 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BTRCQ9Y297 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BTRCQ9Y297 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BTRCQ9Y297 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BTRCQ9Y297 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BTRCQ9Y297 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BTRCQ9Y297 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BTRCQ9Y297 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BTRCQ9Y297 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BTRCQ9Y297 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BTRCQ9Y297 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BTRCQ9Y297 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BTRCQ9Y297 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BTRCQ9Y297 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BTRCQ9Y297 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BTRCQ9Y297 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BTRCQ9Y297 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BTRCQ9Y297 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BTRCQ9Y297 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BTRCQ9Y297 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BTRCQ9Y297 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BTRCQ9Y297 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BTRCQ9Y297 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BTRCQ9Y297 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BTRCQ9Y297 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BTRCQ9Y297 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BTRCQ9Y297 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BTRCQ9Y297 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BTRCQ9Y297 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BTRCQ9Y297 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BTRCQ9Y297 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BTRCQ9Y297 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BTRCQ9Y297 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BTRCQ9Y297 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BTRCQ9Y297 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
BTRCQ9Y297 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
BTRCQ9Y297 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BTRCQ9Y297 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BTRCQ9Y297 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BTRCQ9Y297 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BTRCQ9Y297 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BTRCQ9Y297 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BTRCQ9Y297 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BTRCQ9Y297 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BTRCQ9Y297 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BTRCQ9Y297 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BTRCQ9Y297 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BTRCQ9Y297 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BTRCQ9Y297 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BTRCQ9Y297 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BTRCQ9Y297 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
BTRCQ9Y297 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BTRCQ9Y297 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BTRCQ9Y297 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BTRCQ9Y297 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BTRCQ9Y297 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BTRCQ9Y297 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BTRCQ9Y297 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BTRCQ9Y297 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BTRCQ9Y297 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BTRCQ9Y297 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BTRCQ9Y297 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BTRCQ9Y297 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BTRCQ9Y297 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BTRCQ9Y297 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BTRCQ9Y297 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BTRCQ9Y297 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BTRCQ9Y297 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BTRCQ9Y297 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BTRCQ9Y297 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BTRCQ9Y297 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BTRCQ9Y297 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BTRCQ9Y297 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BTRCQ9Y297 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BTRCQ9Y297 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BTRCQ9Y297 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BTRCQ9Y297 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BTRCQ9Y297 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BTRCQ9Y297 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BTRCQ9Y297 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BTRCQ9Y297 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BTRCQ9Y297 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BTRCQ9Y297 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BTRCQ9Y297 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BTRCQ9Y297 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms