Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y277

VDAC3, Voltage-dependent anion-selective channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDAC3Q9Y277 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VDAC3Q9Y277 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VDAC3Q9Y277 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VDAC3Q9Y277 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VDAC3Q9Y277 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VDAC3Q9Y277 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VDAC3Q9Y277 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VDAC3Q9Y277 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VDAC3Q9Y277 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VDAC3Q9Y277 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VDAC3Q9Y277 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VDAC3Q9Y277 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VDAC3Q9Y277 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VDAC3Q9Y277 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VDAC3Q9Y277 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VDAC3Q9Y277 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VDAC3Q9Y277 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VDAC3Q9Y277 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VDAC3Q9Y277 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VDAC3Q9Y277 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VDAC3Q9Y277 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VDAC3Q9Y277 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VDAC3Q9Y277 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VDAC3Q9Y277 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VDAC3Q9Y277 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VDAC3Q9Y277 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VDAC3Q9Y277 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VDAC3Q9Y277 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VDAC3Q9Y277 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VDAC3Q9Y277 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VDAC3Q9Y277 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VDAC3Q9Y277 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VDAC3Q9Y277 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VDAC3Q9Y277 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VDAC3Q9Y277 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VDAC3Q9Y277 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VDAC3Q9Y277 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VDAC3Q9Y277 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VDAC3Q9Y277 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VDAC3Q9Y277 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VDAC3Q9Y277 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VDAC3Q9Y277 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VDAC3Q9Y277 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VDAC3Q9Y277 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VDAC3Q9Y277 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VDAC3Q9Y277 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VDAC3Q9Y277 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VDAC3Q9Y277 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VDAC3Q9Y277 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VDAC3Q9Y277 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VDAC3Q9Y277 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VDAC3Q9Y277 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VDAC3Q9Y277 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VDAC3Q9Y277 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VDAC3Q9Y277 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VDAC3Q9Y277 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VDAC3Q9Y277 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VDAC3Q9Y277 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VDAC3Q9Y277 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VDAC3Q9Y277 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VDAC3Q9Y277 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VDAC3Q9Y277 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VDAC3Q9Y277 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VDAC3Q9Y277 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VDAC3Q9Y277 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VDAC3Q9Y277 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VDAC3Q9Y277 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VDAC3Q9Y277 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VDAC3Q9Y277 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VDAC3Q9Y277 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VDAC3Q9Y277 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VDAC3Q9Y277 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VDAC3Q9Y277 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VDAC3Q9Y277 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VDAC3Q9Y277 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VDAC3Q9Y277 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VDAC3Q9Y277 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VDAC3Q9Y277 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VDAC3Q9Y277 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VDAC3Q9Y277 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VDAC3Q9Y277 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VDAC3Q9Y277 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VDAC3Q9Y277 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VDAC3Q9Y277 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VDAC3Q9Y277 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VDAC3Q9Y277 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VDAC3Q9Y277 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VDAC3Q9Y277 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VDAC3Q9Y277 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
VDAC3Q9Y277 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VDAC3Q9Y277 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VDAC3Q9Y277 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VDAC3Q9Y277 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VDAC3Q9Y277 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VDAC3Q9Y277 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VDAC3Q9Y277 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VDAC3Q9Y277 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VDAC3Q9Y277 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VDAC3Q9Y277 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VDAC3Q9Y277 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms