Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RCE1Q9Y256 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCE1Q9Y256 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCE1Q9Y256 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCE1Q9Y256 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCE1Q9Y256 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCE1Q9Y256 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RCE1Q9Y256 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RCE1Q9Y256 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RCE1Q9Y256 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RCE1Q9Y256 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RCE1Q9Y256 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RCE1Q9Y256 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RCE1Q9Y256 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RCE1Q9Y256 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RCE1Q9Y256 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RCE1Q9Y256 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RCE1Q9Y256 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RCE1Q9Y256 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCE1Q9Y256 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCE1Q9Y256 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCE1Q9Y256 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCE1Q9Y256 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCE1Q9Y256 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCE1Q9Y256 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCE1Q9Y256 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCE1Q9Y256 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCE1Q9Y256 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCE1Q9Y256 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RCE1Q9Y256 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RCE1Q9Y256 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RCE1Q9Y256 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RCE1Q9Y256 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RCE1Q9Y256 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RCE1Q9Y256 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RCE1Q9Y256 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RCE1Q9Y256 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RCE1Q9Y256 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RCE1Q9Y256 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RCE1Q9Y256 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RCE1Q9Y256 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RCE1Q9Y256 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RCE1Q9Y256 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RCE1Q9Y256 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RCE1Q9Y256 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RCE1Q9Y256 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RCE1Q9Y256 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RCE1Q9Y256 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RCE1Q9Y256 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RCE1Q9Y256 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RCE1Q9Y256 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RCE1Q9Y256 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RCE1Q9Y256 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RCE1Q9Y256 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RCE1Q9Y256 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RCE1Q9Y256 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RCE1Q9Y256 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RCE1Q9Y256 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RCE1Q9Y256 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RCE1Q9Y256 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RCE1Q9Y256 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RCE1Q9Y256 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RCE1Q9Y256 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RCE1Q9Y256 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RCE1Q9Y256 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RCE1Q9Y256 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RCE1Q9Y256 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RCE1Q9Y256 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RCE1Q9Y256 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RCE1Q9Y256 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RCE1Q9Y256 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RCE1Q9Y256 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RCE1Q9Y256 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RCE1Q9Y256 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RCE1Q9Y256 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RCE1Q9Y256 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RCE1Q9Y256 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RCE1Q9Y256 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RCE1Q9Y256 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RCE1Q9Y256 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RCE1Q9Y256 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RCE1Q9Y256 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RCE1Q9Y256 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RCE1Q9Y256 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RCE1Q9Y256 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RCE1Q9Y256 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RCE1Q9Y256 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RCE1Q9Y256 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RCE1Q9Y256 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RCE1Q9Y256 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RCE1Q9Y256 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RCE1Q9Y256 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RCE1Q9Y256 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RCE1Q9Y256 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RCE1Q9Y256 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RCE1Q9Y256 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RCE1Q9Y256 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RCE1Q9Y256 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RCE1Q9Y256 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RCE1Q9Y256 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms