Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ35

SRRM2, Serine/arginine repetitive matrix protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM2Q9UQ35 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SRRM2Q9UQ35 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRRM2Q9UQ35 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 641.2 ms