Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SHANK2Q9UPX8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SHANK2Q9UPX8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SHANK2Q9UPX8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SHANK2Q9UPX8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
SHANK2Q9UPX8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
SHANK2Q9UPX8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SHANK2Q9UPX8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SHANK2Q9UPX8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SHANK2Q9UPX8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
SHANK2Q9UPX8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
SHANK2Q9UPX8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SHANK2Q9UPX8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
SHANK2Q9UPX8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
SHANK2Q9UPX8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
SHANK2Q9UPX8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
SHANK2Q9UPX8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
SHANK2Q9UPX8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
SHANK2Q9UPX8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
SHANK2Q9UPX8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SHANK2Q9UPX8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
SHANK2Q9UPX8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SHANK2Q9UPX8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SHANK2Q9UPX8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SHANK2Q9UPX8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SHANK2Q9UPX8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SHANK2Q9UPX8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
SHANK2Q9UPX8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
SHANK2Q9UPX8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SHANK2Q9UPX8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SHANK2Q9UPX8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SHANK2Q9UPX8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
SHANK2Q9UPX8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SHANK2Q9UPX8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SHANK2Q9UPX8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SHANK2Q9UPX8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SHANK2Q9UPX8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
SHANK2Q9UPX8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
SHANK2Q9UPX8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
SHANK2Q9UPX8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
SHANK2Q9UPX8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
SHANK2Q9UPX8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
SHANK2Q9UPX8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SHANK2Q9UPX8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SHANK2Q9UPX8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SHANK2Q9UPX8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
SHANK2Q9UPX8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SHANK2Q9UPX8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
SHANK2Q9UPX8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SHANK2Q9UPX8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SHANK2Q9UPX8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SHANK2Q9UPX8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SHANK2Q9UPX8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SHANK2Q9UPX8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SHANK2Q9UPX8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SHANK2Q9UPX8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SHANK2Q9UPX8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SHANK2Q9UPX8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SHANK2Q9UPX8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
SHANK2Q9UPX8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
SHANK2Q9UPX8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SHANK2Q9UPX8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SHANK2Q9UPX8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SHANK2Q9UPX8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SHANK2Q9UPX8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SHANK2Q9UPX8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SHANK2Q9UPX8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SHANK2Q9UPX8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SHANK2Q9UPX8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
SHANK2Q9UPX8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SHANK2Q9UPX8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SHANK2Q9UPX8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SHANK2Q9UPX8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SHANK2Q9UPX8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SHANK2Q9UPX8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SHANK2Q9UPX8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SHANK2Q9UPX8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SHANK2Q9UPX8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SHANK2Q9UPX8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SHANK2Q9UPX8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SHANK2Q9UPX8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SHANK2Q9UPX8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SHANK2Q9UPX8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SHANK2Q9UPX8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SHANK2Q9UPX8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SHANK2Q9UPX8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SHANK2Q9UPX8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SHANK2Q9UPX8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SHANK2Q9UPX8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SHANK2Q9UPX8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SHANK2Q9UPX8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SHANK2Q9UPX8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SHANK2Q9UPX8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SHANK2Q9UPX8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SHANK2Q9UPX8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SHANK2Q9UPX8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SHANK2Q9UPX8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SHANK2Q9UPX8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SHANK2Q9UPX8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
SHANK2Q9UPX8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms