Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMG5Q9UPR3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMG5Q9UPR3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMG5Q9UPR3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMG5Q9UPR3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMG5Q9UPR3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMG5Q9UPR3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMG5Q9UPR3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMG5Q9UPR3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMG5Q9UPR3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMG5Q9UPR3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMG5Q9UPR3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SMG5Q9UPR3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMG5Q9UPR3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMG5Q9UPR3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMG5Q9UPR3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMG5Q9UPR3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMG5Q9UPR3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMG5Q9UPR3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMG5Q9UPR3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMG5Q9UPR3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SMG5Q9UPR3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMG5Q9UPR3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMG5Q9UPR3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMG5Q9UPR3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMG5Q9UPR3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SMG5Q9UPR3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMG5Q9UPR3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMG5Q9UPR3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMG5Q9UPR3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMG5Q9UPR3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMG5Q9UPR3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMG5Q9UPR3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMG5Q9UPR3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMG5Q9UPR3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMG5Q9UPR3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMG5Q9UPR3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMG5Q9UPR3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMG5Q9UPR3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMG5Q9UPR3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMG5Q9UPR3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMG5Q9UPR3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMG5Q9UPR3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMG5Q9UPR3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMG5Q9UPR3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SMG5Q9UPR3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMG5Q9UPR3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMG5Q9UPR3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMG5Q9UPR3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMG5Q9UPR3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMG5Q9UPR3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMG5Q9UPR3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMG5Q9UPR3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMG5Q9UPR3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMG5Q9UPR3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMG5Q9UPR3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMG5Q9UPR3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMG5Q9UPR3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SMG5Q9UPR3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMG5Q9UPR3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SMG5Q9UPR3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMG5Q9UPR3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMG5Q9UPR3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMG5Q9UPR3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMG5Q9UPR3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMG5Q9UPR3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMG5Q9UPR3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SMG5Q9UPR3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMG5Q9UPR3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SMG5Q9UPR3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SMG5Q9UPR3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMG5Q9UPR3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMG5Q9UPR3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMG5Q9UPR3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMG5Q9UPR3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SMG5Q9UPR3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMG5Q9UPR3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMG5Q9UPR3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMG5Q9UPR3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMG5Q9UPR3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMG5Q9UPR3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMG5Q9UPR3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMG5Q9UPR3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMG5Q9UPR3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SMG5Q9UPR3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMG5Q9UPR3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SMG5Q9UPR3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMG5Q9UPR3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMG5Q9UPR3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMG5Q9UPR3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMG5Q9UPR3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMG5Q9UPR3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMG5Q9UPR3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMG5Q9UPR3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMG5Q9UPR3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMG5Q9UPR3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMG5Q9UPR3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMG5Q9UPR3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMG5Q9UPR3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMG5Q9UPR3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms