Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AGAP1Q9UPQ3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AGAP1Q9UPQ3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AGAP1Q9UPQ3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AGAP1Q9UPQ3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AGAP1Q9UPQ3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AGAP1Q9UPQ3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AGAP1Q9UPQ3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AGAP1Q9UPQ3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AGAP1Q9UPQ3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AGAP1Q9UPQ3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AGAP1Q9UPQ3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AGAP1Q9UPQ3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
AGAP1Q9UPQ3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AGAP1Q9UPQ3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
AGAP1Q9UPQ3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AGAP1Q9UPQ3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
AGAP1Q9UPQ3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AGAP1Q9UPQ3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AGAP1Q9UPQ3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AGAP1Q9UPQ3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AGAP1Q9UPQ3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AGAP1Q9UPQ3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AGAP1Q9UPQ3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AGAP1Q9UPQ3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AGAP1Q9UPQ3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AGAP1Q9UPQ3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AGAP1Q9UPQ3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AGAP1Q9UPQ3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AGAP1Q9UPQ3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AGAP1Q9UPQ3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AGAP1Q9UPQ3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AGAP1Q9UPQ3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AGAP1Q9UPQ3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AGAP1Q9UPQ3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AGAP1Q9UPQ3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AGAP1Q9UPQ3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AGAP1Q9UPQ3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
AGAP1Q9UPQ3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AGAP1Q9UPQ3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AGAP1Q9UPQ3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AGAP1Q9UPQ3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AGAP1Q9UPQ3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AGAP1Q9UPQ3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AGAP1Q9UPQ3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AGAP1Q9UPQ3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AGAP1Q9UPQ3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AGAP1Q9UPQ3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
AGAP1Q9UPQ3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AGAP1Q9UPQ3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AGAP1Q9UPQ3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms