Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX6Q9UNH7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX6Q9UNH7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX6Q9UNH7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX6Q9UNH7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX6Q9UNH7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX6Q9UNH7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX6Q9UNH7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX6Q9UNH7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX6Q9UNH7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX6Q9UNH7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX6Q9UNH7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX6Q9UNH7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX6Q9UNH7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX6Q9UNH7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX6Q9UNH7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNX6Q9UNH7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNX6Q9UNH7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX6Q9UNH7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX6Q9UNH7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX6Q9UNH7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX6Q9UNH7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX6Q9UNH7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX6Q9UNH7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX6Q9UNH7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX6Q9UNH7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX6Q9UNH7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX6Q9UNH7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX6Q9UNH7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX6Q9UNH7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX6Q9UNH7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX6Q9UNH7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX6Q9UNH7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX6Q9UNH7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX6Q9UNH7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX6Q9UNH7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX6Q9UNH7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX6Q9UNH7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX6Q9UNH7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX6Q9UNH7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX6Q9UNH7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX6Q9UNH7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX6Q9UNH7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX6Q9UNH7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX6Q9UNH7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX6Q9UNH7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX6Q9UNH7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX6Q9UNH7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX6Q9UNH7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX6Q9UNH7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX6Q9UNH7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX6Q9UNH7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX6Q9UNH7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX6Q9UNH7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX6Q9UNH7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX6Q9UNH7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX6Q9UNH7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX6Q9UNH7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX6Q9UNH7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX6Q9UNH7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX6Q9UNH7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX6Q9UNH7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX6Q9UNH7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX6Q9UNH7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX6Q9UNH7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX6Q9UNH7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX6Q9UNH7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX6Q9UNH7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX6Q9UNH7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX6Q9UNH7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX6Q9UNH7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX6Q9UNH7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX6Q9UNH7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX6Q9UNH7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX6Q9UNH7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX6Q9UNH7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX6Q9UNH7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX6Q9UNH7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX6Q9UNH7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX6Q9UNH7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX6Q9UNH7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX6Q9UNH7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX6Q9UNH7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX6Q9UNH7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX6Q9UNH7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX6Q9UNH7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX6Q9UNH7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX6Q9UNH7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX6Q9UNH7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX6Q9UNH7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX6Q9UNH7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX6Q9UNH7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX6Q9UNH7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX6Q9UNH7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX6Q9UNH7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX6Q9UNH7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX6Q9UNH7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX6Q9UNH7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX6Q9UNH7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX6Q9UNH7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms