Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
ALKQ9UM73 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
ALKQ9UM73 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ALKQ9UM73 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
ALKQ9UM73 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
ALKQ9UM73 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC34.93■■■■□ 3.18
ALKQ9UM73 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
ALKQ9UM73 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
ALKQ9UM73 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ALKQ9UM73 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
ALKQ9UM73 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
ALKQ9UM73 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
ALKQ9UM73 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
ALKQ9UM73 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
ALKQ9UM73 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
ALKQ9UM73 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
ALKQ9UM73 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ALKQ9UM73 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
ALKQ9UM73 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
ALKQ9UM73 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
ALKQ9UM73 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
ALKQ9UM73 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ALKQ9UM73 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
ALKQ9UM73 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
ALKQ9UM73 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ALKQ9UM73 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
ALKQ9UM73 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ALKQ9UM73 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
ALKQ9UM73 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
ALKQ9UM73 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
ALKQ9UM73 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
ALKQ9UM73 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
ALKQ9UM73 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
ALKQ9UM73 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
ALKQ9UM73 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
ALKQ9UM73 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ALKQ9UM73 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ALKQ9UM73 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ALKQ9UM73 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ALKQ9UM73 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ALKQ9UM73 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
ALKQ9UM73 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
ALKQ9UM73 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ALKQ9UM73 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
ALKQ9UM73 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ALKQ9UM73 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ALKQ9UM73 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ALKQ9UM73 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
ALKQ9UM73 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
ALKQ9UM73 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
ALKQ9UM73 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
ALKQ9UM73 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
ALKQ9UM73 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
ALKQ9UM73 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
ALKQ9UM73 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
ALKQ9UM73 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ALKQ9UM73 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
ALKQ9UM73 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
ALKQ9UM73 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
ALKQ9UM73 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
ALKQ9UM73 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
ALKQ9UM73 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
ALKQ9UM73 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
ALKQ9UM73 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
ALKQ9UM73 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
ALKQ9UM73 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
ALKQ9UM73 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
ALKQ9UM73 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
ALKQ9UM73 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
ALKQ9UM73 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
ALKQ9UM73 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
ALKQ9UM73 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.15
ALKQ9UM73 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
ALKQ9UM73 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
ALKQ9UM73 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ALKQ9UM73 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ALKQ9UM73 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ALKQ9UM73 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ALKQ9UM73 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ALKQ9UM73 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ALKQ9UM73 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ALKQ9UM73 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ALKQ9UM73 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ALKQ9UM73 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
ALKQ9UM73 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
ALKQ9UM73 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
ALKQ9UM73 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ALKQ9UM73 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ALKQ9UM73 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ALKQ9UM73 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
ALKQ9UM73 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
ALKQ9UM73 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ALKQ9UM73 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ALKQ9UM73 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ALKQ9UM73 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ALKQ9UM73 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
ALKQ9UM73 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
ALKQ9UM73 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ALKQ9UM73 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
ALKQ9UM73 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms