Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TPCN1Q9ULQ1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TPCN1Q9ULQ1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TPCN1Q9ULQ1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TPCN1Q9ULQ1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TPCN1Q9ULQ1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TPCN1Q9ULQ1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TPCN1Q9ULQ1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TPCN1Q9ULQ1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TPCN1Q9ULQ1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TPCN1Q9ULQ1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TPCN1Q9ULQ1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TPCN1Q9ULQ1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TPCN1Q9ULQ1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TPCN1Q9ULQ1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TPCN1Q9ULQ1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TPCN1Q9ULQ1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TPCN1Q9ULQ1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TPCN1Q9ULQ1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TPCN1Q9ULQ1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TPCN1Q9ULQ1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TPCN1Q9ULQ1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TPCN1Q9ULQ1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TPCN1Q9ULQ1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TPCN1Q9ULQ1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TPCN1Q9ULQ1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TPCN1Q9ULQ1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TPCN1Q9ULQ1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TPCN1Q9ULQ1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TPCN1Q9ULQ1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TPCN1Q9ULQ1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TPCN1Q9ULQ1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TPCN1Q9ULQ1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TPCN1Q9ULQ1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TPCN1Q9ULQ1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TPCN1Q9ULQ1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TPCN1Q9ULQ1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TPCN1Q9ULQ1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TPCN1Q9ULQ1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TPCN1Q9ULQ1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TPCN1Q9ULQ1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TPCN1Q9ULQ1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TPCN1Q9ULQ1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TPCN1Q9ULQ1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TPCN1Q9ULQ1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TPCN1Q9ULQ1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TPCN1Q9ULQ1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TPCN1Q9ULQ1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TPCN1Q9ULQ1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TPCN1Q9ULQ1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TPCN1Q9ULQ1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TPCN1Q9ULQ1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TPCN1Q9ULQ1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TPCN1Q9ULQ1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TPCN1Q9ULQ1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TPCN1Q9ULQ1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TPCN1Q9ULQ1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TPCN1Q9ULQ1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TPCN1Q9ULQ1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TPCN1Q9ULQ1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TPCN1Q9ULQ1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TPCN1Q9ULQ1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TPCN1Q9ULQ1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TPCN1Q9ULQ1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TPCN1Q9ULQ1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TPCN1Q9ULQ1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TPCN1Q9ULQ1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TPCN1Q9ULQ1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TPCN1Q9ULQ1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TPCN1Q9ULQ1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TPCN1Q9ULQ1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TPCN1Q9ULQ1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TPCN1Q9ULQ1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TPCN1Q9ULQ1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TPCN1Q9ULQ1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TPCN1Q9ULQ1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TPCN1Q9ULQ1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TPCN1Q9ULQ1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TPCN1Q9ULQ1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TPCN1Q9ULQ1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TPCN1Q9ULQ1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TPCN1Q9ULQ1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TPCN1Q9ULQ1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TPCN1Q9ULQ1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TPCN1Q9ULQ1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TPCN1Q9ULQ1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TPCN1Q9ULQ1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TPCN1Q9ULQ1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TPCN1Q9ULQ1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TPCN1Q9ULQ1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TPCN1Q9ULQ1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TPCN1Q9ULQ1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TPCN1Q9ULQ1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TPCN1Q9ULQ1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TPCN1Q9ULQ1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TPCN1Q9ULQ1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TPCN1Q9ULQ1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TPCN1Q9ULQ1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TPCN1Q9ULQ1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TPCN1Q9ULQ1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
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