Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL25

RAB21, Ras-related protein Rab-21, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB21Q9UL25 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB21Q9UL25 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB21Q9UL25 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB21Q9UL25 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB21Q9UL25 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB21Q9UL25 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB21Q9UL25 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB21Q9UL25 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB21Q9UL25 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB21Q9UL25 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB21Q9UL25 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB21Q9UL25 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB21Q9UL25 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB21Q9UL25 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB21Q9UL25 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB21Q9UL25 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB21Q9UL25 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB21Q9UL25 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB21Q9UL25 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB21Q9UL25 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB21Q9UL25 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB21Q9UL25 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB21Q9UL25 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB21Q9UL25 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB21Q9UL25 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB21Q9UL25 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB21Q9UL25 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB21Q9UL25 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB21Q9UL25 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB21Q9UL25 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB21Q9UL25 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB21Q9UL25 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB21Q9UL25 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB21Q9UL25 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB21Q9UL25 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB21Q9UL25 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB21Q9UL25 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB21Q9UL25 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB21Q9UL25 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB21Q9UL25 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB21Q9UL25 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB21Q9UL25 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB21Q9UL25 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB21Q9UL25 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB21Q9UL25 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB21Q9UL25 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB21Q9UL25 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB21Q9UL25 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB21Q9UL25 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB21Q9UL25 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB21Q9UL25 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB21Q9UL25 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB21Q9UL25 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB21Q9UL25 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB21Q9UL25 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB21Q9UL25 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB21Q9UL25 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB21Q9UL25 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB21Q9UL25 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB21Q9UL25 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB21Q9UL25 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB21Q9UL25 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB21Q9UL25 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB21Q9UL25 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB21Q9UL25 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB21Q9UL25 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB21Q9UL25 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB21Q9UL25 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB21Q9UL25 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB21Q9UL25 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB21Q9UL25 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB21Q9UL25 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB21Q9UL25 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB21Q9UL25 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB21Q9UL25 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB21Q9UL25 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB21Q9UL25 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB21Q9UL25 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB21Q9UL25 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB21Q9UL25 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB21Q9UL25 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB21Q9UL25 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB21Q9UL25 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB21Q9UL25 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB21Q9UL25 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB21Q9UL25 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB21Q9UL25 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB21Q9UL25 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB21Q9UL25 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB21Q9UL25 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB21Q9UL25 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB21Q9UL25 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB21Q9UL25 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB21Q9UL25 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB21Q9UL25 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB21Q9UL25 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB21Q9UL25 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB21Q9UL25 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB21Q9UL25 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB21Q9UL25 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms