Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO4Q9UKT5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO4Q9UKT5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO4Q9UKT5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO4Q9UKT5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO4Q9UKT5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO4Q9UKT5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO4Q9UKT5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO4Q9UKT5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO4Q9UKT5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO4Q9UKT5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO4Q9UKT5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO4Q9UKT5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO4Q9UKT5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO4Q9UKT5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO4Q9UKT5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO4Q9UKT5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO4Q9UKT5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO4Q9UKT5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO4Q9UKT5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO4Q9UKT5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO4Q9UKT5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO4Q9UKT5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO4Q9UKT5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO4Q9UKT5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO4Q9UKT5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO4Q9UKT5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO4Q9UKT5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO4Q9UKT5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO4Q9UKT5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO4Q9UKT5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO4Q9UKT5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO4Q9UKT5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FBXO4Q9UKT5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO4Q9UKT5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO4Q9UKT5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO4Q9UKT5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO4Q9UKT5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO4Q9UKT5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO4Q9UKT5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO4Q9UKT5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO4Q9UKT5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO4Q9UKT5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO4Q9UKT5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO4Q9UKT5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO4Q9UKT5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO4Q9UKT5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO4Q9UKT5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO4Q9UKT5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO4Q9UKT5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO4Q9UKT5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO4Q9UKT5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO4Q9UKT5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO4Q9UKT5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO4Q9UKT5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO4Q9UKT5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO4Q9UKT5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO4Q9UKT5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO4Q9UKT5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO4Q9UKT5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO4Q9UKT5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO4Q9UKT5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO4Q9UKT5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO4Q9UKT5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO4Q9UKT5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO4Q9UKT5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO4Q9UKT5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO4Q9UKT5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO4Q9UKT5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO4Q9UKT5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO4Q9UKT5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO4Q9UKT5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FBXO4Q9UKT5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO4Q9UKT5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO4Q9UKT5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO4Q9UKT5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO4Q9UKT5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO4Q9UKT5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXO4Q9UKT5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXO4Q9UKT5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXO4Q9UKT5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO4Q9UKT5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO4Q9UKT5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO4Q9UKT5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO4Q9UKT5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO4Q9UKT5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO4Q9UKT5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO4Q9UKT5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO4Q9UKT5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO4Q9UKT5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO4Q9UKT5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO4Q9UKT5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO4Q9UKT5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO4Q9UKT5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO4Q9UKT5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO4Q9UKT5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO4Q9UKT5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO4Q9UKT5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO4Q9UKT5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO4Q9UKT5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms