Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRTO4Q9UKD2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MRTO4Q9UKD2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRTO4Q9UKD2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRTO4Q9UKD2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRTO4Q9UKD2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRTO4Q9UKD2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRTO4Q9UKD2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRTO4Q9UKD2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRTO4Q9UKD2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRTO4Q9UKD2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MRTO4Q9UKD2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRTO4Q9UKD2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRTO4Q9UKD2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRTO4Q9UKD2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRTO4Q9UKD2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRTO4Q9UKD2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRTO4Q9UKD2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MRTO4Q9UKD2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRTO4Q9UKD2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MRTO4Q9UKD2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRTO4Q9UKD2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRTO4Q9UKD2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRTO4Q9UKD2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRTO4Q9UKD2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRTO4Q9UKD2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRTO4Q9UKD2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRTO4Q9UKD2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRTO4Q9UKD2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRTO4Q9UKD2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRTO4Q9UKD2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRTO4Q9UKD2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MRTO4Q9UKD2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MRTO4Q9UKD2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRTO4Q9UKD2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRTO4Q9UKD2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRTO4Q9UKD2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRTO4Q9UKD2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRTO4Q9UKD2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRTO4Q9UKD2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRTO4Q9UKD2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRTO4Q9UKD2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRTO4Q9UKD2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRTO4Q9UKD2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRTO4Q9UKD2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRTO4Q9UKD2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRTO4Q9UKD2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRTO4Q9UKD2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MRTO4Q9UKD2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRTO4Q9UKD2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRTO4Q9UKD2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRTO4Q9UKD2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRTO4Q9UKD2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRTO4Q9UKD2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRTO4Q9UKD2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRTO4Q9UKD2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRTO4Q9UKD2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRTO4Q9UKD2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRTO4Q9UKD2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRTO4Q9UKD2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRTO4Q9UKD2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRTO4Q9UKD2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRTO4Q9UKD2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRTO4Q9UKD2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRTO4Q9UKD2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRTO4Q9UKD2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRTO4Q9UKD2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRTO4Q9UKD2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRTO4Q9UKD2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRTO4Q9UKD2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MRTO4Q9UKD2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRTO4Q9UKD2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRTO4Q9UKD2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRTO4Q9UKD2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MRTO4Q9UKD2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRTO4Q9UKD2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRTO4Q9UKD2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRTO4Q9UKD2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRTO4Q9UKD2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRTO4Q9UKD2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRTO4Q9UKD2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRTO4Q9UKD2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRTO4Q9UKD2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRTO4Q9UKD2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MRTO4Q9UKD2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRTO4Q9UKD2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRTO4Q9UKD2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRTO4Q9UKD2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRTO4Q9UKD2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRTO4Q9UKD2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRTO4Q9UKD2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MRTO4Q9UKD2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MRTO4Q9UKD2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRTO4Q9UKD2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRTO4Q9UKD2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MRTO4Q9UKD2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRTO4Q9UKD2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRTO4Q9UKD2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRTO4Q9UKD2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRTO4Q9UKD2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms