Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD1

GMEB2, Glucocorticoid modulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMEB2Q9UKD1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GMEB2Q9UKD1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GMEB2Q9UKD1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GMEB2Q9UKD1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GMEB2Q9UKD1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GMEB2Q9UKD1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GMEB2Q9UKD1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GMEB2Q9UKD1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GMEB2Q9UKD1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GMEB2Q9UKD1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GMEB2Q9UKD1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GMEB2Q9UKD1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GMEB2Q9UKD1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GMEB2Q9UKD1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GMEB2Q9UKD1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GMEB2Q9UKD1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GMEB2Q9UKD1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GMEB2Q9UKD1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GMEB2Q9UKD1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GMEB2Q9UKD1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GMEB2Q9UKD1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GMEB2Q9UKD1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GMEB2Q9UKD1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GMEB2Q9UKD1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GMEB2Q9UKD1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GMEB2Q9UKD1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GMEB2Q9UKD1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GMEB2Q9UKD1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GMEB2Q9UKD1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GMEB2Q9UKD1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GMEB2Q9UKD1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GMEB2Q9UKD1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GMEB2Q9UKD1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GMEB2Q9UKD1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GMEB2Q9UKD1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GMEB2Q9UKD1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GMEB2Q9UKD1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GMEB2Q9UKD1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GMEB2Q9UKD1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GMEB2Q9UKD1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GMEB2Q9UKD1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GMEB2Q9UKD1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GMEB2Q9UKD1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GMEB2Q9UKD1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GMEB2Q9UKD1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GMEB2Q9UKD1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GMEB2Q9UKD1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GMEB2Q9UKD1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GMEB2Q9UKD1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GMEB2Q9UKD1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GMEB2Q9UKD1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GMEB2Q9UKD1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GMEB2Q9UKD1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GMEB2Q9UKD1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GMEB2Q9UKD1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GMEB2Q9UKD1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GMEB2Q9UKD1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GMEB2Q9UKD1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GMEB2Q9UKD1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GMEB2Q9UKD1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GMEB2Q9UKD1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GMEB2Q9UKD1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GMEB2Q9UKD1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GMEB2Q9UKD1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GMEB2Q9UKD1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GMEB2Q9UKD1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GMEB2Q9UKD1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GMEB2Q9UKD1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GMEB2Q9UKD1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GMEB2Q9UKD1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GMEB2Q9UKD1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GMEB2Q9UKD1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GMEB2Q9UKD1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GMEB2Q9UKD1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GMEB2Q9UKD1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GMEB2Q9UKD1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GMEB2Q9UKD1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GMEB2Q9UKD1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GMEB2Q9UKD1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GMEB2Q9UKD1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GMEB2Q9UKD1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GMEB2Q9UKD1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GMEB2Q9UKD1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GMEB2Q9UKD1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GMEB2Q9UKD1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GMEB2Q9UKD1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GMEB2Q9UKD1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GMEB2Q9UKD1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GMEB2Q9UKD1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GMEB2Q9UKD1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GMEB2Q9UKD1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GMEB2Q9UKD1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GMEB2Q9UKD1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GMEB2Q9UKD1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GMEB2Q9UKD1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GMEB2Q9UKD1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GMEB2Q9UKD1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GMEB2Q9UKD1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GMEB2Q9UKD1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GMEB2Q9UKD1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms