Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TUBE1Q9UJT0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TUBE1Q9UJT0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TUBE1Q9UJT0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TUBE1Q9UJT0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TUBE1Q9UJT0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TUBE1Q9UJT0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TUBE1Q9UJT0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TUBE1Q9UJT0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TUBE1Q9UJT0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TUBE1Q9UJT0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TUBE1Q9UJT0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TUBE1Q9UJT0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TUBE1Q9UJT0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TUBE1Q9UJT0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TUBE1Q9UJT0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TUBE1Q9UJT0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TUBE1Q9UJT0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TUBE1Q9UJT0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TUBE1Q9UJT0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TUBE1Q9UJT0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TUBE1Q9UJT0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TUBE1Q9UJT0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TUBE1Q9UJT0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TUBE1Q9UJT0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TUBE1Q9UJT0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TUBE1Q9UJT0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TUBE1Q9UJT0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TUBE1Q9UJT0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TUBE1Q9UJT0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUBE1Q9UJT0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUBE1Q9UJT0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUBE1Q9UJT0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUBE1Q9UJT0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUBE1Q9UJT0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUBE1Q9UJT0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUBE1Q9UJT0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUBE1Q9UJT0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUBE1Q9UJT0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUBE1Q9UJT0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TUBE1Q9UJT0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TUBE1Q9UJT0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TUBE1Q9UJT0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TUBE1Q9UJT0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TUBE1Q9UJT0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TUBE1Q9UJT0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TUBE1Q9UJT0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TUBE1Q9UJT0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TUBE1Q9UJT0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TUBE1Q9UJT0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TUBE1Q9UJT0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TUBE1Q9UJT0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TUBE1Q9UJT0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TUBE1Q9UJT0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TUBE1Q9UJT0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TUBE1Q9UJT0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TUBE1Q9UJT0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TUBE1Q9UJT0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TUBE1Q9UJT0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TUBE1Q9UJT0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUBE1Q9UJT0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUBE1Q9UJT0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUBE1Q9UJT0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUBE1Q9UJT0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUBE1Q9UJT0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUBE1Q9UJT0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUBE1Q9UJT0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TUBE1Q9UJT0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TUBE1Q9UJT0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TUBE1Q9UJT0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TUBE1Q9UJT0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TUBE1Q9UJT0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TUBE1Q9UJT0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TUBE1Q9UJT0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TUBE1Q9UJT0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TUBE1Q9UJT0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TUBE1Q9UJT0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TUBE1Q9UJT0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TUBE1Q9UJT0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TUBE1Q9UJT0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TUBE1Q9UJT0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TUBE1Q9UJT0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TUBE1Q9UJT0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TUBE1Q9UJT0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TUBE1Q9UJT0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
TUBE1Q9UJT0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TUBE1Q9UJT0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TUBE1Q9UJT0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TUBE1Q9UJT0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TUBE1Q9UJT0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TUBE1Q9UJT0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TUBE1Q9UJT0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TUBE1Q9UJT0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TUBE1Q9UJT0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TUBE1Q9UJT0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TUBE1Q9UJT0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TUBE1Q9UJT0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TUBE1Q9UJT0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TUBE1Q9UJT0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TUBE1Q9UJT0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms