Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDH22Q9UJ99 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDH22Q9UJ99 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDH22Q9UJ99 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDH22Q9UJ99 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDH22Q9UJ99 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH22Q9UJ99 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH22Q9UJ99 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH22Q9UJ99 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH22Q9UJ99 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH22Q9UJ99 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH22Q9UJ99 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH22Q9UJ99 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH22Q9UJ99 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH22Q9UJ99 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH22Q9UJ99 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH22Q9UJ99 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH22Q9UJ99 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CDH22Q9UJ99 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CDH22Q9UJ99 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CDH22Q9UJ99 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDH22Q9UJ99 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDH22Q9UJ99 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDH22Q9UJ99 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDH22Q9UJ99 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDH22Q9UJ99 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDH22Q9UJ99 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDH22Q9UJ99 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDH22Q9UJ99 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDH22Q9UJ99 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CDH22Q9UJ99 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDH22Q9UJ99 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDH22Q9UJ99 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDH22Q9UJ99 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDH22Q9UJ99 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH22Q9UJ99 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH22Q9UJ99 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH22Q9UJ99 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH22Q9UJ99 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH22Q9UJ99 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH22Q9UJ99 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH22Q9UJ99 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDH22Q9UJ99 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDH22Q9UJ99 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDH22Q9UJ99 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDH22Q9UJ99 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDH22Q9UJ99 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CDH22Q9UJ99 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDH22Q9UJ99 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDH22Q9UJ99 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDH22Q9UJ99 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDH22Q9UJ99 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDH22Q9UJ99 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CDH22Q9UJ99 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDH22Q9UJ99 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDH22Q9UJ99 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDH22Q9UJ99 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDH22Q9UJ99 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDH22Q9UJ99 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDH22Q9UJ99 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDH22Q9UJ99 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDH22Q9UJ99 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CDH22Q9UJ99 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDH22Q9UJ99 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDH22Q9UJ99 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDH22Q9UJ99 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDH22Q9UJ99 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDH22Q9UJ99 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDH22Q9UJ99 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CDH22Q9UJ99 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDH22Q9UJ99 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CDH22Q9UJ99 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CDH22Q9UJ99 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDH22Q9UJ99 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDH22Q9UJ99 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDH22Q9UJ99 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDH22Q9UJ99 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDH22Q9UJ99 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDH22Q9UJ99 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDH22Q9UJ99 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDH22Q9UJ99 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDH22Q9UJ99 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDH22Q9UJ99 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDH22Q9UJ99 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDH22Q9UJ99 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDH22Q9UJ99 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDH22Q9UJ99 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDH22Q9UJ99 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDH22Q9UJ99 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDH22Q9UJ99 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDH22Q9UJ99 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDH22Q9UJ99 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDH22Q9UJ99 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDH22Q9UJ99 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDH22Q9UJ99 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDH22Q9UJ99 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDH22Q9UJ99 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDH22Q9UJ99 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDH22Q9UJ99 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDH22Q9UJ99 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms