Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI40

SLC24A2, Sodium/potassium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A2Q9UI40 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC24A2Q9UI40 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC24A2Q9UI40 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC24A2Q9UI40 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC24A2Q9UI40 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC24A2Q9UI40 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC24A2Q9UI40 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC24A2Q9UI40 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC24A2Q9UI40 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC24A2Q9UI40 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC24A2Q9UI40 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC24A2Q9UI40 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC24A2Q9UI40 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC24A2Q9UI40 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC24A2Q9UI40 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC24A2Q9UI40 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC24A2Q9UI40 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC24A2Q9UI40 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC24A2Q9UI40 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC24A2Q9UI40 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC24A2Q9UI40 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC24A2Q9UI40 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC24A2Q9UI40 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC24A2Q9UI40 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC24A2Q9UI40 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC24A2Q9UI40 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC24A2Q9UI40 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC24A2Q9UI40 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC24A2Q9UI40 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC24A2Q9UI40 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC24A2Q9UI40 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC24A2Q9UI40 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC24A2Q9UI40 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC24A2Q9UI40 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC24A2Q9UI40 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC24A2Q9UI40 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC24A2Q9UI40 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC24A2Q9UI40 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC24A2Q9UI40 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC24A2Q9UI40 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC24A2Q9UI40 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC24A2Q9UI40 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC24A2Q9UI40 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC24A2Q9UI40 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC24A2Q9UI40 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC24A2Q9UI40 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC24A2Q9UI40 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC24A2Q9UI40 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC24A2Q9UI40 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC24A2Q9UI40 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC24A2Q9UI40 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms