Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA9Q9UGM1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA9Q9UGM1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA9Q9UGM1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA9Q9UGM1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA9Q9UGM1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA9Q9UGM1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA9Q9UGM1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA9Q9UGM1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA9Q9UGM1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA9Q9UGM1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA9Q9UGM1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA9Q9UGM1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA9Q9UGM1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA9Q9UGM1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA9Q9UGM1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA9Q9UGM1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA9Q9UGM1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA9Q9UGM1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA9Q9UGM1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA9Q9UGM1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA9Q9UGM1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA9Q9UGM1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA9Q9UGM1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA9Q9UGM1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA9Q9UGM1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA9Q9UGM1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA9Q9UGM1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA9Q9UGM1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA9Q9UGM1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA9Q9UGM1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA9Q9UGM1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA9Q9UGM1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA9Q9UGM1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA9Q9UGM1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA9Q9UGM1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA9Q9UGM1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA9Q9UGM1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA9Q9UGM1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA9Q9UGM1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA9Q9UGM1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA9Q9UGM1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA9Q9UGM1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA9Q9UGM1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA9Q9UGM1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA9Q9UGM1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA9Q9UGM1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA9Q9UGM1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA9Q9UGM1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA9Q9UGM1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA9Q9UGM1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA9Q9UGM1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA9Q9UGM1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA9Q9UGM1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA9Q9UGM1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA9Q9UGM1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA9Q9UGM1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA9Q9UGM1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA9Q9UGM1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA9Q9UGM1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA9Q9UGM1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA9Q9UGM1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA9Q9UGM1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA9Q9UGM1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA9Q9UGM1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA9Q9UGM1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA9Q9UGM1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA9Q9UGM1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA9Q9UGM1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA9Q9UGM1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA9Q9UGM1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA9Q9UGM1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA9Q9UGM1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA9Q9UGM1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA9Q9UGM1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA9Q9UGM1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CHRNA9Q9UGM1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA9Q9UGM1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA9Q9UGM1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA9Q9UGM1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA9Q9UGM1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA9Q9UGM1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA9Q9UGM1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA9Q9UGM1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA9Q9UGM1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA9Q9UGM1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA9Q9UGM1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA9Q9UGM1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA9Q9UGM1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA9Q9UGM1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA9Q9UGM1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA9Q9UGM1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA9Q9UGM1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA9Q9UGM1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA9Q9UGM1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA9Q9UGM1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA9Q9UGM1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA9Q9UGM1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA9Q9UGM1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA9Q9UGM1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms