Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK8

MTRR, Methionine synthase reductase, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRRQ9UBK8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTRRQ9UBK8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTRRQ9UBK8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTRRQ9UBK8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTRRQ9UBK8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTRRQ9UBK8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTRRQ9UBK8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MTRRQ9UBK8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MTRRQ9UBK8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTRRQ9UBK8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTRRQ9UBK8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTRRQ9UBK8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTRRQ9UBK8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTRRQ9UBK8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTRRQ9UBK8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTRRQ9UBK8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTRRQ9UBK8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTRRQ9UBK8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTRRQ9UBK8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTRRQ9UBK8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
MTRRQ9UBK8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
MTRRQ9UBK8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTRRQ9UBK8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTRRQ9UBK8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTRRQ9UBK8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTRRQ9UBK8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTRRQ9UBK8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTRRQ9UBK8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTRRQ9UBK8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTRRQ9UBK8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTRRQ9UBK8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTRRQ9UBK8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTRRQ9UBK8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MTRRQ9UBK8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MTRRQ9UBK8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTRRQ9UBK8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTRRQ9UBK8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MTRRQ9UBK8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MTRRQ9UBK8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MTRRQ9UBK8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTRRQ9UBK8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTRRQ9UBK8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTRRQ9UBK8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTRRQ9UBK8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTRRQ9UBK8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTRRQ9UBK8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTRRQ9UBK8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTRRQ9UBK8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTRRQ9UBK8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MTRRQ9UBK8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTRRQ9UBK8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTRRQ9UBK8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTRRQ9UBK8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MTRRQ9UBK8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MTRRQ9UBK8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTRRQ9UBK8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTRRQ9UBK8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTRRQ9UBK8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTRRQ9UBK8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTRRQ9UBK8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MTRRQ9UBK8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MTRRQ9UBK8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MTRRQ9UBK8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MTRRQ9UBK8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MTRRQ9UBK8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MTRRQ9UBK8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTRRQ9UBK8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTRRQ9UBK8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTRRQ9UBK8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTRRQ9UBK8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTRRQ9UBK8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTRRQ9UBK8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTRRQ9UBK8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTRRQ9UBK8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MTRRQ9UBK8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTRRQ9UBK8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTRRQ9UBK8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTRRQ9UBK8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTRRQ9UBK8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTRRQ9UBK8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTRRQ9UBK8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTRRQ9UBK8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTRRQ9UBK8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTRRQ9UBK8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTRRQ9UBK8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTRRQ9UBK8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTRRQ9UBK8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTRRQ9UBK8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTRRQ9UBK8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTRRQ9UBK8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MTRRQ9UBK8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MTRRQ9UBK8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MTRRQ9UBK8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MTRRQ9UBK8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MTRRQ9UBK8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MTRRQ9UBK8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MTRRQ9UBK8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MTRRQ9UBK8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MTRRQ9UBK8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTRRQ9UBK8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms