Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2V4

LRIT1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT1Q9P2V4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LRIT1Q9P2V4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRIT1Q9P2V4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRIT1Q9P2V4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRIT1Q9P2V4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRIT1Q9P2V4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRIT1Q9P2V4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRIT1Q9P2V4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRIT1Q9P2V4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRIT1Q9P2V4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRIT1Q9P2V4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRIT1Q9P2V4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRIT1Q9P2V4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRIT1Q9P2V4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRIT1Q9P2V4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRIT1Q9P2V4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRIT1Q9P2V4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRIT1Q9P2V4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRIT1Q9P2V4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LRIT1Q9P2V4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRIT1Q9P2V4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LRIT1Q9P2V4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRIT1Q9P2V4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRIT1Q9P2V4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRIT1Q9P2V4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRIT1Q9P2V4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRIT1Q9P2V4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRIT1Q9P2V4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRIT1Q9P2V4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LRIT1Q9P2V4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LRIT1Q9P2V4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRIT1Q9P2V4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRIT1Q9P2V4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRIT1Q9P2V4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRIT1Q9P2V4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRIT1Q9P2V4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRIT1Q9P2V4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRIT1Q9P2V4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRIT1Q9P2V4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRIT1Q9P2V4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRIT1Q9P2V4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRIT1Q9P2V4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LRIT1Q9P2V4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRIT1Q9P2V4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRIT1Q9P2V4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LRIT1Q9P2V4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRIT1Q9P2V4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRIT1Q9P2V4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRIT1Q9P2V4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRIT1Q9P2V4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRIT1Q9P2V4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRIT1Q9P2V4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRIT1Q9P2V4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRIT1Q9P2V4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRIT1Q9P2V4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRIT1Q9P2V4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRIT1Q9P2V4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRIT1Q9P2V4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRIT1Q9P2V4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRIT1Q9P2V4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRIT1Q9P2V4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRIT1Q9P2V4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRIT1Q9P2V4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRIT1Q9P2V4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRIT1Q9P2V4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRIT1Q9P2V4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRIT1Q9P2V4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRIT1Q9P2V4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRIT1Q9P2V4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRIT1Q9P2V4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRIT1Q9P2V4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LRIT1Q9P2V4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LRIT1Q9P2V4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRIT1Q9P2V4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRIT1Q9P2V4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRIT1Q9P2V4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRIT1Q9P2V4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRIT1Q9P2V4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRIT1Q9P2V4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRIT1Q9P2V4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LRIT1Q9P2V4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRIT1Q9P2V4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRIT1Q9P2V4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRIT1Q9P2V4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRIT1Q9P2V4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRIT1Q9P2V4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRIT1Q9P2V4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRIT1Q9P2V4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRIT1Q9P2V4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRIT1Q9P2V4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRIT1Q9P2V4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRIT1Q9P2V4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRIT1Q9P2V4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRIT1Q9P2V4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRIT1Q9P2V4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRIT1Q9P2V4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRIT1Q9P2V4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRIT1Q9P2V4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRIT1Q9P2V4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIT1Q9P2V4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms