Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAPAQ9P0L0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAPAQ9P0L0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAPAQ9P0L0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAPAQ9P0L0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VAPAQ9P0L0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAPAQ9P0L0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VAPAQ9P0L0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VAPAQ9P0L0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VAPAQ9P0L0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAPAQ9P0L0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAPAQ9P0L0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
VAPAQ9P0L0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAPAQ9P0L0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAPAQ9P0L0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAPAQ9P0L0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAPAQ9P0L0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAPAQ9P0L0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAPAQ9P0L0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAPAQ9P0L0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
VAPAQ9P0L0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAPAQ9P0L0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAPAQ9P0L0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAPAQ9P0L0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VAPAQ9P0L0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VAPAQ9P0L0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAPAQ9P0L0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAPAQ9P0L0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAPAQ9P0L0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAPAQ9P0L0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAPAQ9P0L0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAPAQ9P0L0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAPAQ9P0L0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAPAQ9P0L0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAPAQ9P0L0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAPAQ9P0L0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAPAQ9P0L0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAPAQ9P0L0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAPAQ9P0L0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAPAQ9P0L0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAPAQ9P0L0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAPAQ9P0L0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAPAQ9P0L0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAPAQ9P0L0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAPAQ9P0L0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAPAQ9P0L0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAPAQ9P0L0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAPAQ9P0L0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAPAQ9P0L0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAPAQ9P0L0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VAPAQ9P0L0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAPAQ9P0L0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAPAQ9P0L0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAPAQ9P0L0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAPAQ9P0L0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAPAQ9P0L0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAPAQ9P0L0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAPAQ9P0L0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAPAQ9P0L0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAPAQ9P0L0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAPAQ9P0L0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAPAQ9P0L0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAPAQ9P0L0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAPAQ9P0L0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAPAQ9P0L0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAPAQ9P0L0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAPAQ9P0L0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAPAQ9P0L0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAPAQ9P0L0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAPAQ9P0L0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAPAQ9P0L0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAPAQ9P0L0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAPAQ9P0L0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAPAQ9P0L0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAPAQ9P0L0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAPAQ9P0L0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAPAQ9P0L0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAPAQ9P0L0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAPAQ9P0L0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAPAQ9P0L0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAPAQ9P0L0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAPAQ9P0L0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAPAQ9P0L0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAPAQ9P0L0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAPAQ9P0L0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAPAQ9P0L0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAPAQ9P0L0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAPAQ9P0L0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAPAQ9P0L0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAPAQ9P0L0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAPAQ9P0L0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAPAQ9P0L0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAPAQ9P0L0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAPAQ9P0L0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAPAQ9P0L0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAPAQ9P0L0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAPAQ9P0L0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAPAQ9P0L0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAPAQ9P0L0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAPAQ9P0L0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms