Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHMP5Q9NZZ3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHMP5Q9NZZ3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHMP5Q9NZZ3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHMP5Q9NZZ3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHMP5Q9NZZ3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHMP5Q9NZZ3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHMP5Q9NZZ3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHMP5Q9NZZ3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHMP5Q9NZZ3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHMP5Q9NZZ3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHMP5Q9NZZ3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHMP5Q9NZZ3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHMP5Q9NZZ3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHMP5Q9NZZ3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CHMP5Q9NZZ3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHMP5Q9NZZ3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHMP5Q9NZZ3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHMP5Q9NZZ3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHMP5Q9NZZ3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHMP5Q9NZZ3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHMP5Q9NZZ3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHMP5Q9NZZ3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHMP5Q9NZZ3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHMP5Q9NZZ3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHMP5Q9NZZ3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHMP5Q9NZZ3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHMP5Q9NZZ3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHMP5Q9NZZ3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHMP5Q9NZZ3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CHMP5Q9NZZ3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CHMP5Q9NZZ3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CHMP5Q9NZZ3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CHMP5Q9NZZ3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHMP5Q9NZZ3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHMP5Q9NZZ3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHMP5Q9NZZ3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHMP5Q9NZZ3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHMP5Q9NZZ3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHMP5Q9NZZ3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHMP5Q9NZZ3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHMP5Q9NZZ3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CHMP5Q9NZZ3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHMP5Q9NZZ3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHMP5Q9NZZ3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHMP5Q9NZZ3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHMP5Q9NZZ3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHMP5Q9NZZ3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHMP5Q9NZZ3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHMP5Q9NZZ3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHMP5Q9NZZ3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHMP5Q9NZZ3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHMP5Q9NZZ3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHMP5Q9NZZ3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHMP5Q9NZZ3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHMP5Q9NZZ3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHMP5Q9NZZ3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHMP5Q9NZZ3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHMP5Q9NZZ3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHMP5Q9NZZ3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHMP5Q9NZZ3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CHMP5Q9NZZ3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHMP5Q9NZZ3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHMP5Q9NZZ3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHMP5Q9NZZ3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHMP5Q9NZZ3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHMP5Q9NZZ3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHMP5Q9NZZ3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHMP5Q9NZZ3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHMP5Q9NZZ3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CHMP5Q9NZZ3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHMP5Q9NZZ3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHMP5Q9NZZ3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHMP5Q9NZZ3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHMP5Q9NZZ3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CHMP5Q9NZZ3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHMP5Q9NZZ3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CHMP5Q9NZZ3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHMP5Q9NZZ3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHMP5Q9NZZ3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHMP5Q9NZZ3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHMP5Q9NZZ3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHMP5Q9NZZ3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHMP5Q9NZZ3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHMP5Q9NZZ3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHMP5Q9NZZ3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHMP5Q9NZZ3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHMP5Q9NZZ3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHMP5Q9NZZ3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHMP5Q9NZZ3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHMP5Q9NZZ3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CHMP5Q9NZZ3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHMP5Q9NZZ3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHMP5Q9NZZ3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHMP5Q9NZZ3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHMP5Q9NZZ3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHMP5Q9NZZ3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHMP5Q9NZZ3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CHMP5Q9NZZ3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHMP5Q9NZZ3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms