Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZS2

KLRF1, Killer cell lectin-like receptor subfamily F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRF1Q9NZS2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLRF1Q9NZS2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLRF1Q9NZS2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLRF1Q9NZS2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLRF1Q9NZS2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLRF1Q9NZS2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLRF1Q9NZS2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLRF1Q9NZS2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLRF1Q9NZS2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLRF1Q9NZS2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLRF1Q9NZS2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLRF1Q9NZS2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLRF1Q9NZS2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLRF1Q9NZS2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLRF1Q9NZS2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLRF1Q9NZS2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLRF1Q9NZS2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLRF1Q9NZS2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLRF1Q9NZS2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLRF1Q9NZS2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLRF1Q9NZS2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLRF1Q9NZS2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLRF1Q9NZS2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLRF1Q9NZS2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLRF1Q9NZS2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLRF1Q9NZS2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLRF1Q9NZS2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLRF1Q9NZS2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLRF1Q9NZS2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLRF1Q9NZS2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLRF1Q9NZS2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLRF1Q9NZS2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLRF1Q9NZS2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLRF1Q9NZS2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLRF1Q9NZS2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KLRF1Q9NZS2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLRF1Q9NZS2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLRF1Q9NZS2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLRF1Q9NZS2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLRF1Q9NZS2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLRF1Q9NZS2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLRF1Q9NZS2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLRF1Q9NZS2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLRF1Q9NZS2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLRF1Q9NZS2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLRF1Q9NZS2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLRF1Q9NZS2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLRF1Q9NZS2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLRF1Q9NZS2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLRF1Q9NZS2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLRF1Q9NZS2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KLRF1Q9NZS2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLRF1Q9NZS2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLRF1Q9NZS2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLRF1Q9NZS2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLRF1Q9NZS2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLRF1Q9NZS2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLRF1Q9NZS2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLRF1Q9NZS2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLRF1Q9NZS2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLRF1Q9NZS2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLRF1Q9NZS2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLRF1Q9NZS2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLRF1Q9NZS2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLRF1Q9NZS2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLRF1Q9NZS2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLRF1Q9NZS2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLRF1Q9NZS2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLRF1Q9NZS2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLRF1Q9NZS2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KLRF1Q9NZS2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLRF1Q9NZS2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KLRF1Q9NZS2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLRF1Q9NZS2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLRF1Q9NZS2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLRF1Q9NZS2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLRF1Q9NZS2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLRF1Q9NZS2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLRF1Q9NZS2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLRF1Q9NZS2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLRF1Q9NZS2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLRF1Q9NZS2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLRF1Q9NZS2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLRF1Q9NZS2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLRF1Q9NZS2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLRF1Q9NZS2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KLRF1Q9NZS2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KLRF1Q9NZS2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KLRF1Q9NZS2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLRF1Q9NZS2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLRF1Q9NZS2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLRF1Q9NZS2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLRF1Q9NZS2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLRF1Q9NZS2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KLRF1Q9NZS2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLRF1Q9NZS2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KLRF1Q9NZS2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLRF1Q9NZS2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLRF1Q9NZS2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KLRF1Q9NZS2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms