Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMOD2Q9NZR1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMOD2Q9NZR1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMOD2Q9NZR1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMOD2Q9NZR1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMOD2Q9NZR1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMOD2Q9NZR1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMOD2Q9NZR1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMOD2Q9NZR1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMOD2Q9NZR1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMOD2Q9NZR1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMOD2Q9NZR1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMOD2Q9NZR1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMOD2Q9NZR1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMOD2Q9NZR1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TMOD2Q9NZR1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMOD2Q9NZR1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMOD2Q9NZR1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TMOD2Q9NZR1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMOD2Q9NZR1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TMOD2Q9NZR1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TMOD2Q9NZR1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TMOD2Q9NZR1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
TMOD2Q9NZR1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMOD2Q9NZR1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMOD2Q9NZR1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TMOD2Q9NZR1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMOD2Q9NZR1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMOD2Q9NZR1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMOD2Q9NZR1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMOD2Q9NZR1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMOD2Q9NZR1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMOD2Q9NZR1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMOD2Q9NZR1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TMOD2Q9NZR1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMOD2Q9NZR1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMOD2Q9NZR1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMOD2Q9NZR1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TMOD2Q9NZR1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TMOD2Q9NZR1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMOD2Q9NZR1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMOD2Q9NZR1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMOD2Q9NZR1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMOD2Q9NZR1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TMOD2Q9NZR1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMOD2Q9NZR1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TMOD2Q9NZR1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMOD2Q9NZR1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TMOD2Q9NZR1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMOD2Q9NZR1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMOD2Q9NZR1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMOD2Q9NZR1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMOD2Q9NZR1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMOD2Q9NZR1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMOD2Q9NZR1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMOD2Q9NZR1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMOD2Q9NZR1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMOD2Q9NZR1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMOD2Q9NZR1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TMOD2Q9NZR1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMOD2Q9NZR1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMOD2Q9NZR1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMOD2Q9NZR1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMOD2Q9NZR1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMOD2Q9NZR1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMOD2Q9NZR1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMOD2Q9NZR1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMOD2Q9NZR1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMOD2Q9NZR1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMOD2Q9NZR1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMOD2Q9NZR1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMOD2Q9NZR1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMOD2Q9NZR1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMOD2Q9NZR1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMOD2Q9NZR1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMOD2Q9NZR1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMOD2Q9NZR1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMOD2Q9NZR1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TMOD2Q9NZR1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMOD2Q9NZR1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMOD2Q9NZR1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMOD2Q9NZR1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMOD2Q9NZR1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMOD2Q9NZR1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMOD2Q9NZR1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMOD2Q9NZR1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMOD2Q9NZR1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMOD2Q9NZR1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMOD2Q9NZR1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMOD2Q9NZR1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMOD2Q9NZR1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMOD2Q9NZR1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMOD2Q9NZR1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMOD2Q9NZR1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMOD2Q9NZR1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMOD2Q9NZR1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TMOD2Q9NZR1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMOD2Q9NZR1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMOD2Q9NZR1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMOD2Q9NZR1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
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