Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ3

NCKIPSD, NCK-interacting protein with SH3 domain, humanhuman

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKIPSDQ9NZQ3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCKIPSDQ9NZQ3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCKIPSDQ9NZQ3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCKIPSDQ9NZQ3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCKIPSDQ9NZQ3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCKIPSDQ9NZQ3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCKIPSDQ9NZQ3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCKIPSDQ9NZQ3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCKIPSDQ9NZQ3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCKIPSDQ9NZQ3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCKIPSDQ9NZQ3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCKIPSDQ9NZQ3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCKIPSDQ9NZQ3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NCKIPSDQ9NZQ3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCKIPSDQ9NZQ3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCKIPSDQ9NZQ3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NCKIPSDQ9NZQ3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCKIPSDQ9NZQ3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCKIPSDQ9NZQ3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCKIPSDQ9NZQ3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCKIPSDQ9NZQ3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCKIPSDQ9NZQ3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCKIPSDQ9NZQ3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCKIPSDQ9NZQ3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCKIPSDQ9NZQ3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCKIPSDQ9NZQ3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCKIPSDQ9NZQ3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCKIPSDQ9NZQ3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCKIPSDQ9NZQ3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCKIPSDQ9NZQ3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCKIPSDQ9NZQ3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCKIPSDQ9NZQ3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NCKIPSDQ9NZQ3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCKIPSDQ9NZQ3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCKIPSDQ9NZQ3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCKIPSDQ9NZQ3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCKIPSDQ9NZQ3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCKIPSDQ9NZQ3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NCKIPSDQ9NZQ3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCKIPSDQ9NZQ3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCKIPSDQ9NZQ3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NCKIPSDQ9NZQ3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCKIPSDQ9NZQ3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NCKIPSDQ9NZQ3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCKIPSDQ9NZQ3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCKIPSDQ9NZQ3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NCKIPSDQ9NZQ3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCKIPSDQ9NZQ3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCKIPSDQ9NZQ3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NCKIPSDQ9NZQ3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCKIPSDQ9NZQ3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NCKIPSDQ9NZQ3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCKIPSDQ9NZQ3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCKIPSDQ9NZQ3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCKIPSDQ9NZQ3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCKIPSDQ9NZQ3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCKIPSDQ9NZQ3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCKIPSDQ9NZQ3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCKIPSDQ9NZQ3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCKIPSDQ9NZQ3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCKIPSDQ9NZQ3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCKIPSDQ9NZQ3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCKIPSDQ9NZQ3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCKIPSDQ9NZQ3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NCKIPSDQ9NZQ3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCKIPSDQ9NZQ3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCKIPSDQ9NZQ3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NCKIPSDQ9NZQ3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCKIPSDQ9NZQ3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NCKIPSDQ9NZQ3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCKIPSDQ9NZQ3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCKIPSDQ9NZQ3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCKIPSDQ9NZQ3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCKIPSDQ9NZQ3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCKIPSDQ9NZQ3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NCKIPSDQ9NZQ3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCKIPSDQ9NZQ3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCKIPSDQ9NZQ3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCKIPSDQ9NZQ3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCKIPSDQ9NZQ3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCKIPSDQ9NZQ3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCKIPSDQ9NZQ3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCKIPSDQ9NZQ3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCKIPSDQ9NZQ3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCKIPSDQ9NZQ3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCKIPSDQ9NZQ3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCKIPSDQ9NZQ3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCKIPSDQ9NZQ3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCKIPSDQ9NZQ3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCKIPSDQ9NZQ3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCKIPSDQ9NZQ3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NCKIPSDQ9NZQ3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCKIPSDQ9NZQ3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCKIPSDQ9NZQ3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCKIPSDQ9NZQ3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCKIPSDQ9NZQ3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCKIPSDQ9NZQ3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCKIPSDQ9NZQ3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.9 ms