Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN4

EHD2, EH domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD2Q9NZN4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EHD2Q9NZN4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
EHD2Q9NZN4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EHD2Q9NZN4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EHD2Q9NZN4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EHD2Q9NZN4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EHD2Q9NZN4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EHD2Q9NZN4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EHD2Q9NZN4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EHD2Q9NZN4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EHD2Q9NZN4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EHD2Q9NZN4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EHD2Q9NZN4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EHD2Q9NZN4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EHD2Q9NZN4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EHD2Q9NZN4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
EHD2Q9NZN4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
EHD2Q9NZN4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EHD2Q9NZN4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EHD2Q9NZN4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EHD2Q9NZN4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EHD2Q9NZN4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EHD2Q9NZN4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EHD2Q9NZN4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EHD2Q9NZN4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EHD2Q9NZN4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EHD2Q9NZN4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EHD2Q9NZN4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
EHD2Q9NZN4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EHD2Q9NZN4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EHD2Q9NZN4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EHD2Q9NZN4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EHD2Q9NZN4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EHD2Q9NZN4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EHD2Q9NZN4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EHD2Q9NZN4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EHD2Q9NZN4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EHD2Q9NZN4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EHD2Q9NZN4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EHD2Q9NZN4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EHD2Q9NZN4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EHD2Q9NZN4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EHD2Q9NZN4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
EHD2Q9NZN4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EHD2Q9NZN4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EHD2Q9NZN4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
EHD2Q9NZN4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EHD2Q9NZN4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EHD2Q9NZN4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EHD2Q9NZN4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EHD2Q9NZN4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EHD2Q9NZN4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EHD2Q9NZN4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EHD2Q9NZN4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EHD2Q9NZN4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
EHD2Q9NZN4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
EHD2Q9NZN4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
EHD2Q9NZN4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EHD2Q9NZN4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EHD2Q9NZN4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
EHD2Q9NZN4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EHD2Q9NZN4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EHD2Q9NZN4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EHD2Q9NZN4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EHD2Q9NZN4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
EHD2Q9NZN4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EHD2Q9NZN4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EHD2Q9NZN4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EHD2Q9NZN4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EHD2Q9NZN4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EHD2Q9NZN4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EHD2Q9NZN4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EHD2Q9NZN4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EHD2Q9NZN4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
EHD2Q9NZN4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EHD2Q9NZN4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EHD2Q9NZN4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EHD2Q9NZN4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EHD2Q9NZN4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EHD2Q9NZN4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EHD2Q9NZN4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
EHD2Q9NZN4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EHD2Q9NZN4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EHD2Q9NZN4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
EHD2Q9NZN4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EHD2Q9NZN4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EHD2Q9NZN4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EHD2Q9NZN4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EHD2Q9NZN4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EHD2Q9NZN4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EHD2Q9NZN4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EHD2Q9NZN4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EHD2Q9NZN4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
EHD2Q9NZN4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EHD2Q9NZN4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EHD2Q9NZN4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
EHD2Q9NZN4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EHD2Q9NZN4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EHD2Q9NZN4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EHD2Q9NZN4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms