Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKIRAS1Q9NYS0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKIRAS1Q9NYS0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKIRAS1Q9NYS0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKIRAS1Q9NYS0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKIRAS1Q9NYS0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKIRAS1Q9NYS0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKIRAS1Q9NYS0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKIRAS1Q9NYS0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKIRAS1Q9NYS0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKIRAS1Q9NYS0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKIRAS1Q9NYS0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKIRAS1Q9NYS0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKIRAS1Q9NYS0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKIRAS1Q9NYS0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKIRAS1Q9NYS0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKIRAS1Q9NYS0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKIRAS1Q9NYS0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NKIRAS1Q9NYS0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NKIRAS1Q9NYS0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NKIRAS1Q9NYS0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NKIRAS1Q9NYS0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NKIRAS1Q9NYS0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKIRAS1Q9NYS0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKIRAS1Q9NYS0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKIRAS1Q9NYS0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKIRAS1Q9NYS0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NKIRAS1Q9NYS0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NKIRAS1Q9NYS0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NKIRAS1Q9NYS0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NKIRAS1Q9NYS0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NKIRAS1Q9NYS0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NKIRAS1Q9NYS0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NKIRAS1Q9NYS0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NKIRAS1Q9NYS0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NKIRAS1Q9NYS0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NKIRAS1Q9NYS0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NKIRAS1Q9NYS0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NKIRAS1Q9NYS0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NKIRAS1Q9NYS0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NKIRAS1Q9NYS0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NKIRAS1Q9NYS0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NKIRAS1Q9NYS0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NKIRAS1Q9NYS0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NKIRAS1Q9NYS0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NKIRAS1Q9NYS0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NKIRAS1Q9NYS0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NKIRAS1Q9NYS0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
NKIRAS1Q9NYS0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NKIRAS1Q9NYS0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NKIRAS1Q9NYS0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NKIRAS1Q9NYS0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NKIRAS1Q9NYS0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NKIRAS1Q9NYS0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKIRAS1Q9NYS0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKIRAS1Q9NYS0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKIRAS1Q9NYS0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKIRAS1Q9NYS0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKIRAS1Q9NYS0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKIRAS1Q9NYS0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKIRAS1Q9NYS0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKIRAS1Q9NYS0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKIRAS1Q9NYS0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKIRAS1Q9NYS0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKIRAS1Q9NYS0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKIRAS1Q9NYS0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NKIRAS1Q9NYS0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKIRAS1Q9NYS0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKIRAS1Q9NYS0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKIRAS1Q9NYS0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKIRAS1Q9NYS0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKIRAS1Q9NYS0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKIRAS1Q9NYS0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKIRAS1Q9NYS0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NKIRAS1Q9NYS0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKIRAS1Q9NYS0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKIRAS1Q9NYS0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKIRAS1Q9NYS0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKIRAS1Q9NYS0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKIRAS1Q9NYS0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKIRAS1Q9NYS0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NKIRAS1Q9NYS0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKIRAS1Q9NYS0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKIRAS1Q9NYS0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKIRAS1Q9NYS0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NKIRAS1Q9NYS0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NKIRAS1Q9NYS0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NKIRAS1Q9NYS0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKIRAS1Q9NYS0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKIRAS1Q9NYS0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKIRAS1Q9NYS0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKIRAS1Q9NYS0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKIRAS1Q9NYS0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKIRAS1Q9NYS0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms