Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY26

SLC39A1, Zinc transporter ZIP1, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A1Q9NY26 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC39A1Q9NY26 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC39A1Q9NY26 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC39A1Q9NY26 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC39A1Q9NY26 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC39A1Q9NY26 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC39A1Q9NY26 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC39A1Q9NY26 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC39A1Q9NY26 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC39A1Q9NY26 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC39A1Q9NY26 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC39A1Q9NY26 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC39A1Q9NY26 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC39A1Q9NY26 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC39A1Q9NY26 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC39A1Q9NY26 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC39A1Q9NY26 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC39A1Q9NY26 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC39A1Q9NY26 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC39A1Q9NY26 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC39A1Q9NY26 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC39A1Q9NY26 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC39A1Q9NY26 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC39A1Q9NY26 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC39A1Q9NY26 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC39A1Q9NY26 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC39A1Q9NY26 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC39A1Q9NY26 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC39A1Q9NY26 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC39A1Q9NY26 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC39A1Q9NY26 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC39A1Q9NY26 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC39A1Q9NY26 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC39A1Q9NY26 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC39A1Q9NY26 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC39A1Q9NY26 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC39A1Q9NY26 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC39A1Q9NY26 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC39A1Q9NY26 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC39A1Q9NY26 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC39A1Q9NY26 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC39A1Q9NY26 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC39A1Q9NY26 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC39A1Q9NY26 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC39A1Q9NY26 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC39A1Q9NY26 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC39A1Q9NY26 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC39A1Q9NY26 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC39A1Q9NY26 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms