Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR8

ING3, Inhibitor of growth protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ING3Q9NXR8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ING3Q9NXR8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ING3Q9NXR8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ING3Q9NXR8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ING3Q9NXR8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ING3Q9NXR8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ING3Q9NXR8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ING3Q9NXR8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ING3Q9NXR8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ING3Q9NXR8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ING3Q9NXR8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ING3Q9NXR8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ING3Q9NXR8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ING3Q9NXR8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ING3Q9NXR8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ING3Q9NXR8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ING3Q9NXR8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ING3Q9NXR8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ING3Q9NXR8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ING3Q9NXR8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ING3Q9NXR8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ING3Q9NXR8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ING3Q9NXR8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ING3Q9NXR8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ING3Q9NXR8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ING3Q9NXR8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ING3Q9NXR8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ING3Q9NXR8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ING3Q9NXR8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ING3Q9NXR8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ING3Q9NXR8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ING3Q9NXR8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ING3Q9NXR8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ING3Q9NXR8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ING3Q9NXR8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ING3Q9NXR8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ING3Q9NXR8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ING3Q9NXR8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ING3Q9NXR8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ING3Q9NXR8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ING3Q9NXR8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ING3Q9NXR8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ING3Q9NXR8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ING3Q9NXR8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ING3Q9NXR8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ING3Q9NXR8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ING3Q9NXR8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ING3Q9NXR8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ING3Q9NXR8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ING3Q9NXR8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ING3Q9NXR8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ING3Q9NXR8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ING3Q9NXR8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ING3Q9NXR8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ING3Q9NXR8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ING3Q9NXR8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ING3Q9NXR8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ING3Q9NXR8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ING3Q9NXR8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ING3Q9NXR8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ING3Q9NXR8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ING3Q9NXR8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ING3Q9NXR8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ING3Q9NXR8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ING3Q9NXR8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ING3Q9NXR8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ING3Q9NXR8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ING3Q9NXR8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ING3Q9NXR8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ING3Q9NXR8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
ING3Q9NXR8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ING3Q9NXR8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ING3Q9NXR8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ING3Q9NXR8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ING3Q9NXR8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ING3Q9NXR8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ING3Q9NXR8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ING3Q9NXR8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ING3Q9NXR8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ING3Q9NXR8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ING3Q9NXR8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ING3Q9NXR8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ING3Q9NXR8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ING3Q9NXR8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ING3Q9NXR8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ING3Q9NXR8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ING3Q9NXR8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ING3Q9NXR8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ING3Q9NXR8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ING3Q9NXR8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ING3Q9NXR8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ING3Q9NXR8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ING3Q9NXR8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ING3Q9NXR8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ING3Q9NXR8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ING3Q9NXR8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ING3Q9NXR8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ING3Q9NXR8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ING3Q9NXR8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ING3Q9NXR8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms