Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A12Q9NXJ0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A12Q9NXJ0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A12Q9NXJ0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A12Q9NXJ0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A12Q9NXJ0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A12Q9NXJ0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A12Q9NXJ0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A12Q9NXJ0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A12Q9NXJ0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A12Q9NXJ0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A12Q9NXJ0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A12Q9NXJ0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A12Q9NXJ0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A12Q9NXJ0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A12Q9NXJ0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A12Q9NXJ0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A12Q9NXJ0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A12Q9NXJ0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A12Q9NXJ0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A12Q9NXJ0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A12Q9NXJ0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A12Q9NXJ0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A12Q9NXJ0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A12Q9NXJ0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A12Q9NXJ0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A12Q9NXJ0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A12Q9NXJ0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A12Q9NXJ0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A12Q9NXJ0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A12Q9NXJ0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A12Q9NXJ0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A12Q9NXJ0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A12Q9NXJ0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A12Q9NXJ0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A12Q9NXJ0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A12Q9NXJ0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A12Q9NXJ0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A12Q9NXJ0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A12Q9NXJ0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A12Q9NXJ0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A12Q9NXJ0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A12Q9NXJ0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A12Q9NXJ0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A12Q9NXJ0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A12Q9NXJ0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A12Q9NXJ0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A12Q9NXJ0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A12Q9NXJ0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A12Q9NXJ0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A12Q9NXJ0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A12Q9NXJ0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A12Q9NXJ0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A12Q9NXJ0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A12Q9NXJ0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A12Q9NXJ0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A12Q9NXJ0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A12Q9NXJ0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A12Q9NXJ0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A12Q9NXJ0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A12Q9NXJ0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A12Q9NXJ0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A12Q9NXJ0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A12Q9NXJ0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A12Q9NXJ0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A12Q9NXJ0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A12Q9NXJ0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A12Q9NXJ0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A12Q9NXJ0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A12Q9NXJ0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A12Q9NXJ0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A12Q9NXJ0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A12Q9NXJ0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A12Q9NXJ0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A12Q9NXJ0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A12Q9NXJ0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A12Q9NXJ0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A12Q9NXJ0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A12Q9NXJ0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A12Q9NXJ0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A12Q9NXJ0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A12Q9NXJ0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A12Q9NXJ0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A12Q9NXJ0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A12Q9NXJ0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A12Q9NXJ0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A12Q9NXJ0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A12Q9NXJ0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A12Q9NXJ0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A12Q9NXJ0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A12Q9NXJ0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A12Q9NXJ0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A12Q9NXJ0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A12Q9NXJ0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A12Q9NXJ0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A12Q9NXJ0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A12Q9NXJ0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A12Q9NXJ0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A12Q9NXJ0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A12Q9NXJ0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms