Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHBDL2Q9NX52 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHBDL2Q9NX52 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHBDL2Q9NX52 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHBDL2Q9NX52 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHBDL2Q9NX52 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHBDL2Q9NX52 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHBDL2Q9NX52 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHBDL2Q9NX52 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHBDL2Q9NX52 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHBDL2Q9NX52 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHBDL2Q9NX52 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHBDL2Q9NX52 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHBDL2Q9NX52 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHBDL2Q9NX52 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHBDL2Q9NX52 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHBDL2Q9NX52 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHBDL2Q9NX52 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHBDL2Q9NX52 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHBDL2Q9NX52 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHBDL2Q9NX52 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHBDL2Q9NX52 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHBDL2Q9NX52 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHBDL2Q9NX52 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHBDL2Q9NX52 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHBDL2Q9NX52 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHBDL2Q9NX52 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHBDL2Q9NX52 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHBDL2Q9NX52 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHBDL2Q9NX52 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHBDL2Q9NX52 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHBDL2Q9NX52 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHBDL2Q9NX52 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHBDL2Q9NX52 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHBDL2Q9NX52 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RHBDL2Q9NX52 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHBDL2Q9NX52 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHBDL2Q9NX52 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHBDL2Q9NX52 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHBDL2Q9NX52 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHBDL2Q9NX52 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDL2Q9NX52 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDL2Q9NX52 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDL2Q9NX52 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDL2Q9NX52 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDL2Q9NX52 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDL2Q9NX52 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDL2Q9NX52 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDL2Q9NX52 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDL2Q9NX52 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHBDL2Q9NX52 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms