Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDIT4Q9NX09 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDIT4Q9NX09 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDIT4Q9NX09 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDIT4Q9NX09 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDIT4Q9NX09 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDIT4Q9NX09 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDIT4Q9NX09 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDIT4Q9NX09 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDIT4Q9NX09 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDIT4Q9NX09 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DDIT4Q9NX09 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDIT4Q9NX09 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDIT4Q9NX09 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDIT4Q9NX09 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDIT4Q9NX09 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDIT4Q9NX09 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDIT4Q9NX09 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDIT4Q9NX09 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDIT4Q9NX09 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDIT4Q9NX09 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDIT4Q9NX09 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDIT4Q9NX09 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDIT4Q9NX09 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDIT4Q9NX09 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDIT4Q9NX09 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDIT4Q9NX09 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDIT4Q9NX09 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDIT4Q9NX09 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDIT4Q9NX09 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
DDIT4Q9NX09 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDIT4Q9NX09 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DDIT4Q9NX09 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DDIT4Q9NX09 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDIT4Q9NX09 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
DDIT4Q9NX09 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDIT4Q9NX09 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDIT4Q9NX09 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDIT4Q9NX09 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDIT4Q9NX09 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDIT4Q9NX09 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDIT4Q9NX09 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDIT4Q9NX09 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDIT4Q9NX09 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDIT4Q9NX09 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDIT4Q9NX09 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDIT4Q9NX09 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDIT4Q9NX09 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDIT4Q9NX09 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDIT4Q9NX09 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DDIT4Q9NX09 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDIT4Q9NX09 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDIT4Q9NX09 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDIT4Q9NX09 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDIT4Q9NX09 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDIT4Q9NX09 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDIT4Q9NX09 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDIT4Q9NX09 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDIT4Q9NX09 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDIT4Q9NX09 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDIT4Q9NX09 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDIT4Q9NX09 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDIT4Q9NX09 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDIT4Q9NX09 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDIT4Q9NX09 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDIT4Q9NX09 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDIT4Q9NX09 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
DDIT4Q9NX09 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDIT4Q9NX09 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDIT4Q9NX09 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DDIT4Q9NX09 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DDIT4Q9NX09 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDIT4Q9NX09 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDIT4Q9NX09 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDIT4Q9NX09 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDIT4Q9NX09 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDIT4Q9NX09 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDIT4Q9NX09 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDIT4Q9NX09 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDIT4Q9NX09 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDIT4Q9NX09 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
DDIT4Q9NX09 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDIT4Q9NX09 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDIT4Q9NX09 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDIT4Q9NX09 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDIT4Q9NX09 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDIT4Q9NX09 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDIT4Q9NX09 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DDIT4Q9NX09 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDIT4Q9NX09 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDIT4Q9NX09 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDIT4Q9NX09 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
DDIT4Q9NX09 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDIT4Q9NX09 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDIT4Q9NX09 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDIT4Q9NX09 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDIT4Q9NX09 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDIT4Q9NX09 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDIT4Q9NX09 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDIT4Q9NX09 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms