Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf109Q9NX04 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf109Q9NX04 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf109Q9NX04 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf109Q9NX04 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf109Q9NX04 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf109Q9NX04 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf109Q9NX04 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf109Q9NX04 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf109Q9NX04 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf109Q9NX04 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf109Q9NX04 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf109Q9NX04 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf109Q9NX04 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf109Q9NX04 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf109Q9NX04 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf109Q9NX04 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf109Q9NX04 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf109Q9NX04 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf109Q9NX04 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf109Q9NX04 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf109Q9NX04 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf109Q9NX04 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf109Q9NX04 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf109Q9NX04 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf109Q9NX04 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf109Q9NX04 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf109Q9NX04 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf109Q9NX04 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf109Q9NX04 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf109Q9NX04 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf109Q9NX04 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf109Q9NX04 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf109Q9NX04 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf109Q9NX04 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf109Q9NX04 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf109Q9NX04 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf109Q9NX04 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf109Q9NX04 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf109Q9NX04 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf109Q9NX04 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf109Q9NX04 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf109Q9NX04 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf109Q9NX04 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf109Q9NX04 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf109Q9NX04 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf109Q9NX04 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C1orf109Q9NX04 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C1orf109Q9NX04 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1orf109Q9NX04 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1orf109Q9NX04 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1orf109Q9NX04 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1orf109Q9NX04 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf109Q9NX04 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf109Q9NX04 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf109Q9NX04 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf109Q9NX04 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf109Q9NX04 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf109Q9NX04 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf109Q9NX04 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf109Q9NX04 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf109Q9NX04 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf109Q9NX04 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf109Q9NX04 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1orf109Q9NX04 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf109Q9NX04 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf109Q9NX04 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf109Q9NX04 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf109Q9NX04 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf109Q9NX04 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf109Q9NX04 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf109Q9NX04 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf109Q9NX04 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf109Q9NX04 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf109Q9NX04 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf109Q9NX04 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf109Q9NX04 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf109Q9NX04 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf109Q9NX04 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf109Q9NX04 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf109Q9NX04 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf109Q9NX04 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf109Q9NX04 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf109Q9NX04 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf109Q9NX04 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf109Q9NX04 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf109Q9NX04 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1orf109Q9NX04 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1orf109Q9NX04 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1orf109Q9NX04 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
C1orf109Q9NX04 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf109Q9NX04 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf109Q9NX04 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf109Q9NX04 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf109Q9NX04 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf109Q9NX04 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf109Q9NX04 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1orf109Q9NX04 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
C1orf109Q9NX04 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1orf109Q9NX04 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms