Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PARVAQ9NVD7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PARVAQ9NVD7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PARVAQ9NVD7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PARVAQ9NVD7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PARVAQ9NVD7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PARVAQ9NVD7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PARVAQ9NVD7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PARVAQ9NVD7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PARVAQ9NVD7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PARVAQ9NVD7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PARVAQ9NVD7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PARVAQ9NVD7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PARVAQ9NVD7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PARVAQ9NVD7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARVAQ9NVD7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARVAQ9NVD7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARVAQ9NVD7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARVAQ9NVD7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARVAQ9NVD7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARVAQ9NVD7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARVAQ9NVD7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PARVAQ9NVD7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PARVAQ9NVD7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PARVAQ9NVD7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PARVAQ9NVD7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PARVAQ9NVD7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PARVAQ9NVD7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PARVAQ9NVD7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PARVAQ9NVD7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PARVAQ9NVD7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARVAQ9NVD7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARVAQ9NVD7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARVAQ9NVD7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARVAQ9NVD7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PARVAQ9NVD7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARVAQ9NVD7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARVAQ9NVD7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PARVAQ9NVD7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARVAQ9NVD7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PARVAQ9NVD7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
PARVAQ9NVD7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PARVAQ9NVD7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PARVAQ9NVD7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PARVAQ9NVD7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PARVAQ9NVD7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARVAQ9NVD7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARVAQ9NVD7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARVAQ9NVD7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARVAQ9NVD7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PARVAQ9NVD7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARVAQ9NVD7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARVAQ9NVD7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARVAQ9NVD7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARVAQ9NVD7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PARVAQ9NVD7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARVAQ9NVD7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARVAQ9NVD7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARVAQ9NVD7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARVAQ9NVD7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PARVAQ9NVD7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARVAQ9NVD7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARVAQ9NVD7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARVAQ9NVD7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PARVAQ9NVD7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PARVAQ9NVD7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PARVAQ9NVD7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PARVAQ9NVD7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PARVAQ9NVD7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PARVAQ9NVD7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PARVAQ9NVD7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PARVAQ9NVD7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PARVAQ9NVD7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PARVAQ9NVD7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PARVAQ9NVD7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PARVAQ9NVD7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PARVAQ9NVD7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PARVAQ9NVD7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PARVAQ9NVD7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PARVAQ9NVD7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PARVAQ9NVD7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PARVAQ9NVD7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARVAQ9NVD7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARVAQ9NVD7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARVAQ9NVD7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PARVAQ9NVD7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PARVAQ9NVD7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARVAQ9NVD7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARVAQ9NVD7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARVAQ9NVD7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PARVAQ9NVD7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PARVAQ9NVD7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PARVAQ9NVD7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PARVAQ9NVD7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PARVAQ9NVD7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PARVAQ9NVD7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PARVAQ9NVD7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PARVAQ9NVD7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PARVAQ9NVD7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PARVAQ9NVD7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms