Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN7

ACER3, Alkaline ceramidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3Q9NUN7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACER3Q9NUN7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACER3Q9NUN7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACER3Q9NUN7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACER3Q9NUN7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACER3Q9NUN7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACER3Q9NUN7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACER3Q9NUN7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACER3Q9NUN7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACER3Q9NUN7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACER3Q9NUN7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACER3Q9NUN7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACER3Q9NUN7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACER3Q9NUN7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACER3Q9NUN7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACER3Q9NUN7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACER3Q9NUN7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACER3Q9NUN7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACER3Q9NUN7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ACER3Q9NUN7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ACER3Q9NUN7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACER3Q9NUN7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACER3Q9NUN7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ACER3Q9NUN7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACER3Q9NUN7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACER3Q9NUN7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACER3Q9NUN7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACER3Q9NUN7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACER3Q9NUN7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACER3Q9NUN7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACER3Q9NUN7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACER3Q9NUN7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACER3Q9NUN7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACER3Q9NUN7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACER3Q9NUN7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACER3Q9NUN7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACER3Q9NUN7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACER3Q9NUN7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACER3Q9NUN7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACER3Q9NUN7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACER3Q9NUN7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACER3Q9NUN7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACER3Q9NUN7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACER3Q9NUN7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACER3Q9NUN7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACER3Q9NUN7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACER3Q9NUN7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACER3Q9NUN7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACER3Q9NUN7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACER3Q9NUN7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACER3Q9NUN7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACER3Q9NUN7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACER3Q9NUN7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACER3Q9NUN7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACER3Q9NUN7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACER3Q9NUN7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACER3Q9NUN7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACER3Q9NUN7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACER3Q9NUN7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACER3Q9NUN7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACER3Q9NUN7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACER3Q9NUN7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACER3Q9NUN7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACER3Q9NUN7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACER3Q9NUN7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACER3Q9NUN7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ACER3Q9NUN7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACER3Q9NUN7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACER3Q9NUN7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACER3Q9NUN7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACER3Q9NUN7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACER3Q9NUN7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACER3Q9NUN7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACER3Q9NUN7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACER3Q9NUN7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACER3Q9NUN7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACER3Q9NUN7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACER3Q9NUN7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACER3Q9NUN7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACER3Q9NUN7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACER3Q9NUN7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACER3Q9NUN7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACER3Q9NUN7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACER3Q9NUN7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACER3Q9NUN7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACER3Q9NUN7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACER3Q9NUN7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACER3Q9NUN7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ACER3Q9NUN7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACER3Q9NUN7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACER3Q9NUN7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACER3Q9NUN7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACER3Q9NUN7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACER3Q9NUN7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACER3Q9NUN7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACER3Q9NUN7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ACER3Q9NUN7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACER3Q9NUN7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACER3Q9NUN7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACER3Q9NUN7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms