Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTN9

SEMA4G, Semaphorin-4G, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4GQ9NTN9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA4GQ9NTN9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA4GQ9NTN9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA4GQ9NTN9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA4GQ9NTN9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA4GQ9NTN9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA4GQ9NTN9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA4GQ9NTN9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA4GQ9NTN9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA4GQ9NTN9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA4GQ9NTN9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA4GQ9NTN9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA4GQ9NTN9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA4GQ9NTN9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA4GQ9NTN9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA4GQ9NTN9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA4GQ9NTN9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA4GQ9NTN9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA4GQ9NTN9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA4GQ9NTN9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA4GQ9NTN9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA4GQ9NTN9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA4GQ9NTN9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA4GQ9NTN9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA4GQ9NTN9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA4GQ9NTN9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA4GQ9NTN9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA4GQ9NTN9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA4GQ9NTN9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA4GQ9NTN9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA4GQ9NTN9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA4GQ9NTN9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA4GQ9NTN9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA4GQ9NTN9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA4GQ9NTN9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA4GQ9NTN9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA4GQ9NTN9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA4GQ9NTN9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA4GQ9NTN9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA4GQ9NTN9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA4GQ9NTN9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA4GQ9NTN9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA4GQ9NTN9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA4GQ9NTN9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA4GQ9NTN9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA4GQ9NTN9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA4GQ9NTN9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA4GQ9NTN9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA4GQ9NTN9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA4GQ9NTN9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA4GQ9NTN9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA4GQ9NTN9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA4GQ9NTN9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA4GQ9NTN9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA4GQ9NTN9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA4GQ9NTN9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA4GQ9NTN9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA4GQ9NTN9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA4GQ9NTN9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA4GQ9NTN9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEMA4GQ9NTN9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA4GQ9NTN9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA4GQ9NTN9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA4GQ9NTN9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA4GQ9NTN9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA4GQ9NTN9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA4GQ9NTN9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA4GQ9NTN9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA4GQ9NTN9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA4GQ9NTN9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA4GQ9NTN9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA4GQ9NTN9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA4GQ9NTN9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA4GQ9NTN9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA4GQ9NTN9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA4GQ9NTN9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA4GQ9NTN9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA4GQ9NTN9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA4GQ9NTN9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA4GQ9NTN9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA4GQ9NTN9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA4GQ9NTN9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA4GQ9NTN9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA4GQ9NTN9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA4GQ9NTN9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA4GQ9NTN9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA4GQ9NTN9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA4GQ9NTN9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA4GQ9NTN9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA4GQ9NTN9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA4GQ9NTN9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA4GQ9NTN9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA4GQ9NTN9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA4GQ9NTN9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA4GQ9NTN9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA4GQ9NTN9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA4GQ9NTN9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA4GQ9NTN9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA4GQ9NTN9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA4GQ9NTN9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms