Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG7

SIRT3, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-3, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT3Q9NTG7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRT3Q9NTG7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRT3Q9NTG7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRT3Q9NTG7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIRT3Q9NTG7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRT3Q9NTG7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRT3Q9NTG7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRT3Q9NTG7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRT3Q9NTG7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRT3Q9NTG7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRT3Q9NTG7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRT3Q9NTG7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIRT3Q9NTG7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIRT3Q9NTG7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIRT3Q9NTG7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIRT3Q9NTG7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIRT3Q9NTG7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIRT3Q9NTG7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SIRT3Q9NTG7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SIRT3Q9NTG7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIRT3Q9NTG7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIRT3Q9NTG7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIRT3Q9NTG7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIRT3Q9NTG7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIRT3Q9NTG7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIRT3Q9NTG7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIRT3Q9NTG7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIRT3Q9NTG7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIRT3Q9NTG7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIRT3Q9NTG7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIRT3Q9NTG7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIRT3Q9NTG7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIRT3Q9NTG7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SIRT3Q9NTG7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIRT3Q9NTG7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIRT3Q9NTG7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIRT3Q9NTG7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIRT3Q9NTG7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIRT3Q9NTG7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SIRT3Q9NTG7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SIRT3Q9NTG7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SIRT3Q9NTG7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIRT3Q9NTG7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIRT3Q9NTG7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIRT3Q9NTG7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIRT3Q9NTG7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIRT3Q9NTG7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIRT3Q9NTG7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SIRT3Q9NTG7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIRT3Q9NTG7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIRT3Q9NTG7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIRT3Q9NTG7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIRT3Q9NTG7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIRT3Q9NTG7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIRT3Q9NTG7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIRT3Q9NTG7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIRT3Q9NTG7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIRT3Q9NTG7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIRT3Q9NTG7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIRT3Q9NTG7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIRT3Q9NTG7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIRT3Q9NTG7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIRT3Q9NTG7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SIRT3Q9NTG7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIRT3Q9NTG7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SIRT3Q9NTG7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIRT3Q9NTG7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIRT3Q9NTG7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIRT3Q9NTG7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIRT3Q9NTG7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIRT3Q9NTG7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIRT3Q9NTG7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIRT3Q9NTG7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIRT3Q9NTG7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SIRT3Q9NTG7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIRT3Q9NTG7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIRT3Q9NTG7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIRT3Q9NTG7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIRT3Q9NTG7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIRT3Q9NTG7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SIRT3Q9NTG7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SIRT3Q9NTG7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIRT3Q9NTG7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIRT3Q9NTG7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIRT3Q9NTG7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRT3Q9NTG7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRT3Q9NTG7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRT3Q9NTG7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRT3Q9NTG7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRT3Q9NTG7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRT3Q9NTG7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIRT3Q9NTG7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIRT3Q9NTG7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIRT3Q9NTG7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIRT3Q9NTG7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRT3Q9NTG7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRT3Q9NTG7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRT3Q9NTG7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRT3Q9NTG7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRT3Q9NTG7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms