Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNTG1Q9NSN8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNTG1Q9NSN8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNTG1Q9NSN8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNTG1Q9NSN8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNTG1Q9NSN8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SNTG1Q9NSN8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNTG1Q9NSN8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNTG1Q9NSN8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNTG1Q9NSN8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNTG1Q9NSN8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNTG1Q9NSN8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNTG1Q9NSN8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNTG1Q9NSN8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNTG1Q9NSN8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNTG1Q9NSN8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNTG1Q9NSN8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNTG1Q9NSN8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNTG1Q9NSN8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNTG1Q9NSN8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNTG1Q9NSN8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNTG1Q9NSN8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNTG1Q9NSN8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNTG1Q9NSN8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNTG1Q9NSN8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SNTG1Q9NSN8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNTG1Q9NSN8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNTG1Q9NSN8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNTG1Q9NSN8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNTG1Q9NSN8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNTG1Q9NSN8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNTG1Q9NSN8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNTG1Q9NSN8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNTG1Q9NSN8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNTG1Q9NSN8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNTG1Q9NSN8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNTG1Q9NSN8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNTG1Q9NSN8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNTG1Q9NSN8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNTG1Q9NSN8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNTG1Q9NSN8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNTG1Q9NSN8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNTG1Q9NSN8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNTG1Q9NSN8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNTG1Q9NSN8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNTG1Q9NSN8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNTG1Q9NSN8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNTG1Q9NSN8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNTG1Q9NSN8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNTG1Q9NSN8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNTG1Q9NSN8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNTG1Q9NSN8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNTG1Q9NSN8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNTG1Q9NSN8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNTG1Q9NSN8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNTG1Q9NSN8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNTG1Q9NSN8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNTG1Q9NSN8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNTG1Q9NSN8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNTG1Q9NSN8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNTG1Q9NSN8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNTG1Q9NSN8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNTG1Q9NSN8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNTG1Q9NSN8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNTG1Q9NSN8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNTG1Q9NSN8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNTG1Q9NSN8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNTG1Q9NSN8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SNTG1Q9NSN8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNTG1Q9NSN8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNTG1Q9NSN8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNTG1Q9NSN8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNTG1Q9NSN8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNTG1Q9NSN8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNTG1Q9NSN8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNTG1Q9NSN8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNTG1Q9NSN8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNTG1Q9NSN8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNTG1Q9NSN8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNTG1Q9NSN8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNTG1Q9NSN8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNTG1Q9NSN8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNTG1Q9NSN8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNTG1Q9NSN8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNTG1Q9NSN8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNTG1Q9NSN8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNTG1Q9NSN8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNTG1Q9NSN8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNTG1Q9NSN8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNTG1Q9NSN8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNTG1Q9NSN8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms