Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF275Q9NSD4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF275Q9NSD4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF275Q9NSD4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF275Q9NSD4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF275Q9NSD4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF275Q9NSD4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF275Q9NSD4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF275Q9NSD4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF275Q9NSD4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF275Q9NSD4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF275Q9NSD4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF275Q9NSD4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF275Q9NSD4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF275Q9NSD4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF275Q9NSD4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF275Q9NSD4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF275Q9NSD4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF275Q9NSD4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF275Q9NSD4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF275Q9NSD4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF275Q9NSD4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF275Q9NSD4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF275Q9NSD4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF275Q9NSD4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF275Q9NSD4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF275Q9NSD4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF275Q9NSD4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF275Q9NSD4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZNF275Q9NSD4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF275Q9NSD4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF275Q9NSD4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF275Q9NSD4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF275Q9NSD4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF275Q9NSD4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF275Q9NSD4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF275Q9NSD4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF275Q9NSD4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF275Q9NSD4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF275Q9NSD4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF275Q9NSD4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF275Q9NSD4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF275Q9NSD4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF275Q9NSD4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF275Q9NSD4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF275Q9NSD4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF275Q9NSD4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF275Q9NSD4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF275Q9NSD4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF275Q9NSD4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF275Q9NSD4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF275Q9NSD4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF275Q9NSD4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF275Q9NSD4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF275Q9NSD4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF275Q9NSD4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZNF275Q9NSD4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF275Q9NSD4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF275Q9NSD4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF275Q9NSD4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF275Q9NSD4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF275Q9NSD4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF275Q9NSD4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF275Q9NSD4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF275Q9NSD4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF275Q9NSD4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF275Q9NSD4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF275Q9NSD4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF275Q9NSD4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF275Q9NSD4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF275Q9NSD4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF275Q9NSD4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF275Q9NSD4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF275Q9NSD4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF275Q9NSD4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF275Q9NSD4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF275Q9NSD4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF275Q9NSD4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF275Q9NSD4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF275Q9NSD4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF275Q9NSD4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF275Q9NSD4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF275Q9NSD4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF275Q9NSD4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF275Q9NSD4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF275Q9NSD4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF275Q9NSD4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF275Q9NSD4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF275Q9NSD4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF275Q9NSD4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF275Q9NSD4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF275Q9NSD4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF275Q9NSD4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF275Q9NSD4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF275Q9NSD4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF275Q9NSD4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF275Q9NSD4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF275Q9NSD4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF275Q9NSD4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF275Q9NSD4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133 ms