Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS62

THSD1, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD1Q9NS62 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
THSD1Q9NS62 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
THSD1Q9NS62 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
THSD1Q9NS62 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
THSD1Q9NS62 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
THSD1Q9NS62 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
THSD1Q9NS62 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
THSD1Q9NS62 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
THSD1Q9NS62 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
THSD1Q9NS62 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
THSD1Q9NS62 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
THSD1Q9NS62 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
THSD1Q9NS62 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THSD1Q9NS62 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THSD1Q9NS62 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THSD1Q9NS62 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THSD1Q9NS62 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THSD1Q9NS62 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
THSD1Q9NS62 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
THSD1Q9NS62 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
THSD1Q9NS62 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
THSD1Q9NS62 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
THSD1Q9NS62 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
THSD1Q9NS62 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
THSD1Q9NS62 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
THSD1Q9NS62 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THSD1Q9NS62 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
THSD1Q9NS62 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
THSD1Q9NS62 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
THSD1Q9NS62 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
THSD1Q9NS62 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
THSD1Q9NS62 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
THSD1Q9NS62 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THSD1Q9NS62 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THSD1Q9NS62 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
THSD1Q9NS62 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
THSD1Q9NS62 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THSD1Q9NS62 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
THSD1Q9NS62 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
THSD1Q9NS62 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THSD1Q9NS62 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THSD1Q9NS62 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THSD1Q9NS62 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THSD1Q9NS62 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
THSD1Q9NS62 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
THSD1Q9NS62 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
THSD1Q9NS62 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
THSD1Q9NS62 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
THSD1Q9NS62 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
THSD1Q9NS62 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THSD1Q9NS62 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THSD1Q9NS62 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THSD1Q9NS62 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
THSD1Q9NS62 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THSD1Q9NS62 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THSD1Q9NS62 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THSD1Q9NS62 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
THSD1Q9NS62 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THSD1Q9NS62 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
THSD1Q9NS62 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THSD1Q9NS62 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
THSD1Q9NS62 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
THSD1Q9NS62 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
THSD1Q9NS62 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THSD1Q9NS62 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
THSD1Q9NS62 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
THSD1Q9NS62 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
THSD1Q9NS62 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
THSD1Q9NS62 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
THSD1Q9NS62 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
THSD1Q9NS62 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
THSD1Q9NS62 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
THSD1Q9NS62 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
THSD1Q9NS62 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
THSD1Q9NS62 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
THSD1Q9NS62 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
THSD1Q9NS62 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
THSD1Q9NS62 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
THSD1Q9NS62 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
THSD1Q9NS62 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
THSD1Q9NS62 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
THSD1Q9NS62 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
THSD1Q9NS62 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
THSD1Q9NS62 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
THSD1Q9NS62 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
THSD1Q9NS62 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
THSD1Q9NS62 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
THSD1Q9NS62 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
THSD1Q9NS62 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
THSD1Q9NS62 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
THSD1Q9NS62 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
THSD1Q9NS62 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
THSD1Q9NS62 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THSD1Q9NS62 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
THSD1Q9NS62 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THSD1Q9NS62 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
THSD1Q9NS62 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THSD1Q9NS62 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THSD1Q9NS62 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
THSD1Q9NS62 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms