Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KCNIP2Q9NS61 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNIP2Q9NS61 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNIP2Q9NS61 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNIP2Q9NS61 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNIP2Q9NS61 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNIP2Q9NS61 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNIP2Q9NS61 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNIP2Q9NS61 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNIP2Q9NS61 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNIP2Q9NS61 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNIP2Q9NS61 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNIP2Q9NS61 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNIP2Q9NS61 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNIP2Q9NS61 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNIP2Q9NS61 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNIP2Q9NS61 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNIP2Q9NS61 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNIP2Q9NS61 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNIP2Q9NS61 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNIP2Q9NS61 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNIP2Q9NS61 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNIP2Q9NS61 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNIP2Q9NS61 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNIP2Q9NS61 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNIP2Q9NS61 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNIP2Q9NS61 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNIP2Q9NS61 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNIP2Q9NS61 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNIP2Q9NS61 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNIP2Q9NS61 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNIP2Q9NS61 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNIP2Q9NS61 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNIP2Q9NS61 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNIP2Q9NS61 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNIP2Q9NS61 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNIP2Q9NS61 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNIP2Q9NS61 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNIP2Q9NS61 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNIP2Q9NS61 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNIP2Q9NS61 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNIP2Q9NS61 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KCNIP2Q9NS61 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNIP2Q9NS61 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNIP2Q9NS61 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNIP2Q9NS61 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNIP2Q9NS61 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNIP2Q9NS61 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNIP2Q9NS61 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNIP2Q9NS61 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KCNIP2Q9NS61 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KCNIP2Q9NS61 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KCNIP2Q9NS61 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
KCNIP2Q9NS61 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNIP2Q9NS61 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KCNIP2Q9NS61 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNIP2Q9NS61 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KCNIP2Q9NS61 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNIP2Q9NS61 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNIP2Q9NS61 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNIP2Q9NS61 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNIP2Q9NS61 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
KCNIP2Q9NS61 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KCNIP2Q9NS61 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNIP2Q9NS61 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNIP2Q9NS61 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNIP2Q9NS61 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNIP2Q9NS61 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNIP2Q9NS61 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNIP2Q9NS61 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNIP2Q9NS61 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KCNIP2Q9NS61 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNIP2Q9NS61 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNIP2Q9NS61 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNIP2Q9NS61 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNIP2Q9NS61 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNIP2Q9NS61 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNIP2Q9NS61 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNIP2Q9NS61 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNIP2Q9NS61 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNIP2Q9NS61 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNIP2Q9NS61 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNIP2Q9NS61 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNIP2Q9NS61 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNIP2Q9NS61 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNIP2Q9NS61 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNIP2Q9NS61 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms