Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMPRSS4Q9NRS4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMPRSS4Q9NRS4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TMPRSS4Q9NRS4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMPRSS4Q9NRS4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMPRSS4Q9NRS4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TMPRSS4Q9NRS4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMPRSS4Q9NRS4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMPRSS4Q9NRS4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMPRSS4Q9NRS4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMPRSS4Q9NRS4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMPRSS4Q9NRS4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMPRSS4Q9NRS4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMPRSS4Q9NRS4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMPRSS4Q9NRS4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TMPRSS4Q9NRS4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TMPRSS4Q9NRS4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMPRSS4Q9NRS4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMPRSS4Q9NRS4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMPRSS4Q9NRS4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMPRSS4Q9NRS4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMPRSS4Q9NRS4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMPRSS4Q9NRS4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMPRSS4Q9NRS4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMPRSS4Q9NRS4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMPRSS4Q9NRS4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMPRSS4Q9NRS4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMPRSS4Q9NRS4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMPRSS4Q9NRS4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMPRSS4Q9NRS4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMPRSS4Q9NRS4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMPRSS4Q9NRS4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMPRSS4Q9NRS4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMPRSS4Q9NRS4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMPRSS4Q9NRS4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMPRSS4Q9NRS4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMPRSS4Q9NRS4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMPRSS4Q9NRS4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMPRSS4Q9NRS4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMPRSS4Q9NRS4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMPRSS4Q9NRS4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMPRSS4Q9NRS4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMPRSS4Q9NRS4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMPRSS4Q9NRS4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMPRSS4Q9NRS4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMPRSS4Q9NRS4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMPRSS4Q9NRS4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMPRSS4Q9NRS4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMPRSS4Q9NRS4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TMPRSS4Q9NRS4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMPRSS4Q9NRS4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMPRSS4Q9NRS4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMPRSS4Q9NRS4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMPRSS4Q9NRS4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMPRSS4Q9NRS4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMPRSS4Q9NRS4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMPRSS4Q9NRS4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMPRSS4Q9NRS4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMPRSS4Q9NRS4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMPRSS4Q9NRS4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMPRSS4Q9NRS4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMPRSS4Q9NRS4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMPRSS4Q9NRS4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMPRSS4Q9NRS4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TMPRSS4Q9NRS4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMPRSS4Q9NRS4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMPRSS4Q9NRS4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMPRSS4Q9NRS4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMPRSS4Q9NRS4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMPRSS4Q9NRS4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TMPRSS4Q9NRS4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMPRSS4Q9NRS4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMPRSS4Q9NRS4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMPRSS4Q9NRS4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMPRSS4Q9NRS4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMPRSS4Q9NRS4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMPRSS4Q9NRS4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TMPRSS4Q9NRS4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMPRSS4Q9NRS4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TMPRSS4Q9NRS4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMPRSS4Q9NRS4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMPRSS4Q9NRS4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMPRSS4Q9NRS4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMPRSS4Q9NRS4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMPRSS4Q9NRS4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMPRSS4Q9NRS4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMPRSS4Q9NRS4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMPRSS4Q9NRS4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMPRSS4Q9NRS4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMPRSS4Q9NRS4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMPRSS4Q9NRS4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMPRSS4Q9NRS4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TMPRSS4Q9NRS4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMPRSS4Q9NRS4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMPRSS4Q9NRS4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMPRSS4Q9NRS4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMPRSS4Q9NRS4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms