Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHAF3Q9NRP4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SDHAF3Q9NRP4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHAF3Q9NRP4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHAF3Q9NRP4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHAF3Q9NRP4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHAF3Q9NRP4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHAF3Q9NRP4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHAF3Q9NRP4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHAF3Q9NRP4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHAF3Q9NRP4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHAF3Q9NRP4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHAF3Q9NRP4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHAF3Q9NRP4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHAF3Q9NRP4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHAF3Q9NRP4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDHAF3Q9NRP4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDHAF3Q9NRP4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDHAF3Q9NRP4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDHAF3Q9NRP4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDHAF3Q9NRP4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDHAF3Q9NRP4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDHAF3Q9NRP4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDHAF3Q9NRP4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDHAF3Q9NRP4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDHAF3Q9NRP4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDHAF3Q9NRP4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDHAF3Q9NRP4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDHAF3Q9NRP4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDHAF3Q9NRP4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SDHAF3Q9NRP4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDHAF3Q9NRP4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDHAF3Q9NRP4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDHAF3Q9NRP4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDHAF3Q9NRP4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SDHAF3Q9NRP4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SDHAF3Q9NRP4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDHAF3Q9NRP4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SDHAF3Q9NRP4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDHAF3Q9NRP4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDHAF3Q9NRP4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHAF3Q9NRP4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHAF3Q9NRP4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHAF3Q9NRP4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHAF3Q9NRP4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHAF3Q9NRP4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHAF3Q9NRP4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHAF3Q9NRP4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDHAF3Q9NRP4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDHAF3Q9NRP4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDHAF3Q9NRP4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.5 ms