Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
DUOX1Q9NRD9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
DUOX1Q9NRD9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
DUOX1Q9NRD9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
DUOX1Q9NRD9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
DUOX1Q9NRD9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
DUOX1Q9NRD9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
DUOX1Q9NRD9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
DUOX1Q9NRD9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
DUOX1Q9NRD9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
DUOX1Q9NRD9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
DUOX1Q9NRD9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
DUOX1Q9NRD9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
DUOX1Q9NRD9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
DUOX1Q9NRD9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
DUOX1Q9NRD9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
DUOX1Q9NRD9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
DUOX1Q9NRD9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
DUOX1Q9NRD9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
DUOX1Q9NRD9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
DUOX1Q9NRD9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
DUOX1Q9NRD9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
DUOX1Q9NRD9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
DUOX1Q9NRD9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
DUOX1Q9NRD9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
DUOX1Q9NRD9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
DUOX1Q9NRD9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
DUOX1Q9NRD9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
DUOX1Q9NRD9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
DUOX1Q9NRD9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
DUOX1Q9NRD9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
DUOX1Q9NRD9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
DUOX1Q9NRD9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
DUOX1Q9NRD9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
DUOX1Q9NRD9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
DUOX1Q9NRD9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
DUOX1Q9NRD9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DUOX1Q9NRD9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DUOX1Q9NRD9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
DUOX1Q9NRD9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
DUOX1Q9NRD9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
DUOX1Q9NRD9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DUOX1Q9NRD9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DUOX1Q9NRD9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
DUOX1Q9NRD9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
DUOX1Q9NRD9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
DUOX1Q9NRD9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
DUOX1Q9NRD9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
DUOX1Q9NRD9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
DUOX1Q9NRD9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
DUOX1Q9NRD9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
DUOX1Q9NRD9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DUOX1Q9NRD9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
DUOX1Q9NRD9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
DUOX1Q9NRD9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DUOX1Q9NRD9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
DUOX1Q9NRD9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DUOX1Q9NRD9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DUOX1Q9NRD9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
DUOX1Q9NRD9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DUOX1Q9NRD9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DUOX1Q9NRD9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
DUOX1Q9NRD9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
DUOX1Q9NRD9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
DUOX1Q9NRD9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
DUOX1Q9NRD9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
DUOX1Q9NRD9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
DUOX1Q9NRD9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
DUOX1Q9NRD9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
DUOX1Q9NRD9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
DUOX1Q9NRD9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
DUOX1Q9NRD9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
DUOX1Q9NRD9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
DUOX1Q9NRD9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
DUOX1Q9NRD9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
DUOX1Q9NRD9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DUOX1Q9NRD9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
DUOX1Q9NRD9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DUOX1Q9NRD9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
DUOX1Q9NRD9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DUOX1Q9NRD9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
DUOX1Q9NRD9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
DUOX1Q9NRD9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
DUOX1Q9NRD9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
DUOX1Q9NRD9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
DUOX1Q9NRD9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DUOX1Q9NRD9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DUOX1Q9NRD9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
DUOX1Q9NRD9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
DUOX1Q9NRD9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
DUOX1Q9NRD9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DUOX1Q9NRD9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DUOX1Q9NRD9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
DUOX1Q9NRD9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DUOX1Q9NRD9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
DUOX1Q9NRD9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
DUOX1Q9NRD9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
DUOX1Q9NRD9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
DUOX1Q9NRD9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
DUOX1Q9NRD9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms