Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR96

TLR9, Toll-like receptor 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR9Q9NR96 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TLR9Q9NR96 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TLR9Q9NR96 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TLR9Q9NR96 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TLR9Q9NR96 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TLR9Q9NR96 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TLR9Q9NR96 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TLR9Q9NR96 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TLR9Q9NR96 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TLR9Q9NR96 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TLR9Q9NR96 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TLR9Q9NR96 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TLR9Q9NR96 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TLR9Q9NR96 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TLR9Q9NR96 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TLR9Q9NR96 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TLR9Q9NR96 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TLR9Q9NR96 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TLR9Q9NR96 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TLR9Q9NR96 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TLR9Q9NR96 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TLR9Q9NR96 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TLR9Q9NR96 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TLR9Q9NR96 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TLR9Q9NR96 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TLR9Q9NR96 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TLR9Q9NR96 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TLR9Q9NR96 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TLR9Q9NR96 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TLR9Q9NR96 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TLR9Q9NR96 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TLR9Q9NR96 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TLR9Q9NR96 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TLR9Q9NR96 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TLR9Q9NR96 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TLR9Q9NR96 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TLR9Q9NR96 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TLR9Q9NR96 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TLR9Q9NR96 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TLR9Q9NR96 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TLR9Q9NR96 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TLR9Q9NR96 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TLR9Q9NR96 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TLR9Q9NR96 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TLR9Q9NR96 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TLR9Q9NR96 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TLR9Q9NR96 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TLR9Q9NR96 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TLR9Q9NR96 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TLR9Q9NR96 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TLR9Q9NR96 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TLR9Q9NR96 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TLR9Q9NR96 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TLR9Q9NR96 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TLR9Q9NR96 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TLR9Q9NR96 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TLR9Q9NR96 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TLR9Q9NR96 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TLR9Q9NR96 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TLR9Q9NR96 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TLR9Q9NR96 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TLR9Q9NR96 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TLR9Q9NR96 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TLR9Q9NR96 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TLR9Q9NR96 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TLR9Q9NR96 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TLR9Q9NR96 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TLR9Q9NR96 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TLR9Q9NR96 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TLR9Q9NR96 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TLR9Q9NR96 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TLR9Q9NR96 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TLR9Q9NR96 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TLR9Q9NR96 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TLR9Q9NR96 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TLR9Q9NR96 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TLR9Q9NR96 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TLR9Q9NR96 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TLR9Q9NR96 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TLR9Q9NR96 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TLR9Q9NR96 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TLR9Q9NR96 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TLR9Q9NR96 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TLR9Q9NR96 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TLR9Q9NR96 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TLR9Q9NR96 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TLR9Q9NR96 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TLR9Q9NR96 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TLR9Q9NR96 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TLR9Q9NR96 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TLR9Q9NR96 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TLR9Q9NR96 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TLR9Q9NR96 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TLR9Q9NR96 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TLR9Q9NR96 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TLR9Q9NR96 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TLR9Q9NR96 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TLR9Q9NR96 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TLR9Q9NR96 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TLR9Q9NR96 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms